糖鎖構造生物学教室

研究業績

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2026年

論文・総説 17

  1. Enzymatic basis of branching and extension of O-Man glycans for keratan sulfate biosynthesis

    Tomoya Itoh, Hide-Nori Tanaka, Mohit Pareek, Masamichi Nagae, Hiroshi Manya, Akemi Ido, Sushil K. Mishra, Yasuhiko Kizuka

    J. Biol. Chem., 302(2), 111140 (2026)DOI

    要旨

    O-マンノース型糖鎖は、脳では糖転移酵素GnT-IX（MGAT5B）により枝分かれ構造がつくられる。GnT-IXと類似酵素GnT-Vの構造比較と変異体解析から、R304残基が基質の選択に重要であることを見出した。GnT-IX欠損マウスの脳では、O-Man型糖鎖に付くケラタン硫酸（KS）が大きく減少した。KS合成酵素は枝分かれした糖鎖に高い活性を示し、枝分かれ構造がKS伸長の足場として働くことが示された。

  2. Structural determinants of site-specific core fucosylation in human transferrin: insights from crystallography and molecular dynamics

    Shiho Ohno, Yuki Goto, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Glycobiology, 36(4), cwag013 (2026)DOI

    要旨

    ヒトトランスフェリンはAsn432とAsn630の2か所にN型糖鎖をもつが、血清ではAsn630の糖鎖だけがコアフコシル化されている。本研究では、この部位特異性を決める構造要因を、結晶構造の解析と分子動力学（MD）シミュレーションにより調べた。13の結晶構造の比較から、Asn630はAsn432より溶媒への露出面積が大きいことが示され、糖転移酵素FUT8の近づきやすさが違いを生むと考えられる。

  3. Integrative structural analysis of lacto-N-fucopentaose I recognition by antibodies R-17F and R-13E using NMR, docking, and molecular dynamics simulations

    Shiho Ohno, Akito Ohuchi, Yuki Saitoh, Noriyoshi Manabe, Tsutomu Fujimura, Noriyuki Yuasa, Yuji Matsuzaki, Makoto Tsuiji, Toshisuke Kawasaki, Yoshiki Yamaguchi

    Glycobiology, 36(4), cwag016 (2026)DOI

    要旨

    未分化なヒトiPS細胞に発現する糖鎖lacto-N-fucopentaose I（LNFP I）と、これを認識する抗糖鎖モノクローナル抗体R-17F、R-13Eをモデル系とした。NMR、ドッキング計算、MDシミュレーションを組み合わせた構造解析により、各抗体がLNFP Iのどの糖残基を認識するかを明らかにした。両抗体は結合部位の形が異なり、この違いが特異性の差を生むと考えられる。

  4. Crystal structure of epidermal growth factor domain-specific O-linked N-acetylglucosamine transferase reveals a conserved N–R–R constellation for uridine diphosphate recognition in the GT61 family

    Yuko Tashima, Masamichi Nagae, Jiaoyang Jiang, Tetsuya Okajima

    PNAS Nexus, 5(4), pgag115 (2026)DOI

    要旨

    EOGTは、小胞体内でEGFドメインのSer/Thr残基にO-GlcNAcを付加する糖転移酵素（GT61ファミリー）で、その変異はAdams–Oliver症候群の原因となる。EOGTとUDPの複合体の結晶構造を1.8 Åで決定し、GT-B型の構造をとることを示した。UDPの認識には二価金属イオンもDxDモチーフも使われず、Asn1つとArg2つからなる「N–R–R constellation」が中心的な役割を果たしていた。

  5. Bisecting GlcNAc in N-glycan regulates synaptic maturation

    Yuta Hashimoto, Wanxue Bao, Shun Yamaguchi, Masashi Watanave, Misuzu Hashimoto, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Kyoko Matsuzawa, Yuko Tokoro, Yasuhiko Kizuka

    Biochem. J., 483(10), 1877–1890 (2026)DOI

    要旨

    バイセクティングGlcNAcは、N型糖鎖の中央に付く枝分かれ構造で、糖転移酵素MGAT3（GnT-III）により作られ、神経細胞に多い。本研究では、MGAT3欠損マウスの脳で神経細胞の形態と糖タンパク質の発現・局在を解析した。欠損マウス由来の培養大脳皮質ニューロンでは神経突起の伸長とスパインの成熟が障害され、生体内の神経活動も低下しており、この糖鎖がシナプスの成熟に重要であることが示された。

  6. Conformational Analysis of Glycans (2)

    Yoshiki Yamaguchi

    Glycoscience: A Global Roadmap 2025 from Japan. Springer, Singapore, 79–81 (2026)DOI

  7. Summary and Future Perspectives in Glycoscience

    Shoko Nishihara, Jun Hirabayashi, Yoshiki Yamaguchi, Tomio Yabe, Kazunari Akiyoshi, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Shinya Fushinobu

    Glycoscience: A Global Roadmap 2025 from Japan. Springer, Singapore, 715–726 (2026)DOI

  8. Ion Mobility Mass Spectrometry (IM-MS)

    Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Glycoscience: A Global Roadmap 2025 from Japan. Springer, Singapore, 17–19 (2026)DOI

    要旨

    糖鎖の構造と機能の関係を明らかにする手法として、イオンモビリティ質量分析（IM-MS）を取り上げた。IM-MSは、イオンが気相中を移動する速さの違いから分子の形や大きさを反映した断面積を測定でき、質量だけでは区別できない異性体の分離に適している。本稿では、糖鎖解析への応用例と、標準物質やデータベースの整備といった課題、今後の展望を紹介した。

  9. Prediction of Novel Disease-Related Regions in SIGLEC-7 by In Silico and Biochemical Analyses

    Sayo Morishita, Masaya Hane, Di Wu, Ken Kitajima, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Chihiro Sato

    Int. J. Mol. Sci., 27(12), 5489 (2026)DOI

    要旨

    SIGLEC-7は、主にNK細胞や単球に発現する受容体で、シアル酸を認識して免疫応答を抑制する方向に働く。本研究では、in silico解析と生化学的解析を組み合わせて、疾患に関わる可能性のある領域を予測した。立体構造モデル上で変異の位置と保存性を評価して候補を絞り込み、生化学的に検証した結果、シアル酸結合部位以外にも機能に影響しうる領域が存在することが示された。

  10. Branching of O-mannose glycans regulates node of Ranvier organization and saltatory conduction

    Shu Tomita, Taichi Nakaishi, Toshiyuki Ishii, Kazuya Ono, Honoka Fujimori, Misuzu Hashimoto, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Masamitsu Shimazawa, Miyako Nakano, Daisuke Kato, Yasuhiko Kizuka

    Commun. Biol., (2026)DOI

    要旨

    MGAT5Bは、O-マンノース型糖鎖に枝分かれ構造を作る脳特異的な酵素である。MGAT5B欠損マウスでは、速い信号伝達（跳躍伝導）に必要なランビエ絞輪が異常に広がり、神経伝達が遅くなるとともにタイミングにばらつきが生じ、運動能力が低下した。そのしくみとして、MGAT5BがNF186に枝分かれしたO-Man型糖鎖を付けることで、NF186とContactin 1の相互作用が調節されることを示した。

  11. 自然免疫で働くレクチン受容体による自己と非自己のリガンド認識機構

    長江雅倫，山﨑 晶

    医学のあゆみ，298(5)，354–361 (2026)

    要旨

    C型レクチン受容体は自然免疫受容体の一種で、主にDectin-1クラスターとDectin-2クラスターの2つの遺伝子群にコードされる。これらの受容体は、レクチンドメインを使って糖鎖、脂質、核酸、結晶性物質など多様な自己・非自己のリガンドを認識する。本総説では、各受容体のリガンドと分子認識の仕組みを立体構造に基づいて解説し、フグ由来Mincleの構造をもとに認識の進化についても考察した。

  12. Chain-length-selective cooperative assembly underlies β-glucan recognition by Dectin-1

    Noriyoshi Manabe, Atsuji Kodama, Tokito Osaki, Hanako Chiba, Yuki Yamaguchi, Feng-Yueh Chan, Koichi Kato, Takayuki Uchihashi, Susumu Uchiyama, Yoshiki Yamaguchi

    Commun. Chem., (2026)DOI

    要旨

    Dectin-1は、真菌の細胞壁に多いβ-1,3-グルカンを認識し、自然免疫を開始させる受容体である。本研究では、鎖長のそろわない天然のβ-グルカンであるラミナリンの認識機構を調べた。ネイティブ質量分析により、Dectin-1とラミナリンが3：3の比で複合体をつくり、DP 25〜36の鎖が選択的に取り込まれることを示した。結合は協同的で、高速原子間力顕微鏡でも受容体の集合がとらえられた。

  13. Loss of the Asn333 high-mannose N-glycan impairs ACP3 folding and drives disease-associated dysfunction

    Noriyoshi Manabe, Kazuyoshi Itoh, Shiho Ohno, Ayumi Miura, Aika Miyata, Sora Yashima, Sachiko Komatsu, Tsutomu Fujimura, Hisatoshi Hanamatsu, Jun-ichi Furukawa, Kiyohiko Angata, Akira Togayachi, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Yoshihiro Akimoto, Tadashi Kaname, Shoko Nishihara, Yoshiki Yamaguchi

    iScience, 29, 117746 (2026)DOI

    要旨

    前立腺酸性ホスファターゼ（ACP3）は分泌型の糖タンパク質で、3か所にN型糖鎖をもつ。Asn94とAsn220には複合型糖鎖が、Asn333には高マンノース型糖鎖が結合していた。前二者の糖鎖を欠く変異体は分泌も活性も保たれたが、Asn333の糖鎖を欠く変異体は小胞体内で凝集し活性を失った。MD計算からこの糖鎖は構造を固定する「留め具」として働くと示され、患者では重い神経発達異常が認められた。

  14. Temperature-controlled conformational switching of squaramides enabled by side-chain hydrogen bonding

    Kazusa Kuyama, Kimiko Tanaka, Fumi Takeda, Sakura Nakagawa, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Kosuke Katagiri, Masatoshi Kawahata, Isao Azumaya, Iwao Okamoto, Hiroyuki Kagechika, Aya Tanatani

    RSC Adv., 16(41), 48015–48019 (2026)DOI

    要旨

    スクアラミドは、温度や溶媒によって立体配座を可逆的に切り替えられる素材として注目されている。本研究では、水素結合を受け取るTEG側鎖を導入したスクアラミドを合成した。低温では分子内水素結合により(trans, trans)型が、高温ではエントロピーの寄与により(cis, trans)型が優勢となることが可変温度NMRとvan't Hoff解析で示され、側鎖の水素結合が切り替えに不可欠であることが分かった。

  15. Species-specific disordered regions and temperature dependence of bisecting GlcNAc-synthetic enzyme MGAT3

    Wanxue Bao, Shunji Natsuka, Anne Harduin-Lepers, Masamichi Nagae, Takahiro Yamasaki, Atsushi Iwasawa, Kyoko Matsuzawa, Yasuhiko Kizuka

    J. Biol. Chem., 302(11), 113604 (2026)DOI

    要旨

    MGAT3（GnT-III）は、N型糖鎖にバイセクティングGlcNAcを付加する糖転移酵素である。本研究では哺乳類、爬虫類、両生類、魚類のMGAT3を比較し、触媒ドメインは保存される一方、天然変性領域のLoopとTailは種により大きく異なることを示した。ツメガエルの酵素は熱に弱く低温でのみ活性を示したが、その脳にはバイセクティングGlcNAcが豊富に存在し、進化の中で適応的に変化したことが示唆された。

  16. Structure-Based and Glycosylation-Aware Interpretation of Glycogene Variants

    Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Tadashi Kaname, Shoko Nishihara, Yoshiki Yamaguchi

    Glycobiology, (2026)DOI

    要旨

    グライコジーンのミスセンス変異は先天性糖鎖異常症の原因となるが、多くは病的意義不明のまま残されている。グライコジーンは配列保存性が低く、従来の予測法は働きにくい。本総説では、AlphaFold構造から得られる溶媒露出度、安定性変化（ΔΔG）、予測信頼度を用いるVarMeterおよびVarMeter2による変異解釈を整理した。糖鎖を外した構造でΔΔGを計算している点が大きな限界である。

  17. Implication of N-glycosylations on B4GALNT-1 enzyme in its molecular assembly and function

    Yuhsuke Ohmi, Hiroka Koyanagi, Takako Ito, Yuka Imao, Masamichi Nagae, Mariko Kambe, Robiul Hasan Bhuiyan, Mohammad Abul Hasnat, Farhana Yesmin, Akira Takeda, Orie Tajima, Hiromune Ando, Hirokazu Yagi, Akira Togayachi, Ken Kitajima, Chihiro Sato, Koichi Furukawa, Keiko Furukawa

    Biol. Open, 15, bio062865 (2026)DOI

    要旨

    B4GALNT1（GM2/GD2合成酵素）は複合型ガングリオシドの合成に必須の糖転移酵素で、自身も3か所にN型糖鎖をもつ。各部位のAsnをGlnに置換した変異体では、糖鎖の欠損に応じてGM2の発現と酵素活性が低下し、ゴルジ体への局在も損なわれた。非還元条件のウェスタンブロットからN1（Asn79）の欠損で二量体形成が大きく低下し、N1が主要な、N3が補助的な役割を担うことが示唆された。

学会発表 32

  1. 3月

    Fmoc保護糖アミノ酸で観測される化学交換の1Hおよび13C NMR解析

    上松 亮平，橋本 奈央子，坂本 泉，吉田 慎一朗，真鍋 法義，權 垠相，金谷 章生，山口 芳樹

    日本化学会第106春季年会、千葉、2026年3月、P2-3am-71

  2. 3月

    マトリグリカン立体異性体のオリゴマー化

    田口 遥斗，宮本 廉，小寺 康太，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    日本農芸化学会2026年度京都大会、京都、2026年3月

  3. 3月

    長鎖マトリグリカンオリゴ糖及びそのデンドリマーの効率的合成とラミニン結合親和性評価

    小寺 康太，宮本 廉，田村 敬裕，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    日本農芸化学会2026年度京都大会、京都、2026年3月

  4. 3月

    タンパク質立体構造情報を基盤としたミスセンス変異病原性予測法VarMeter2の構築

    山口 芳樹，大野 詩歩，小倉 千佳，矢吹 茜，伊藤 和義，真鍋 法義，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，古川 潤一，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子

    日本薬学会第146年会、大阪、2026年3月、28-22-am08

  5. 3月

    C型レクチン様受容体Dectin-1の病的バリアントが発現および機能に与える影響

    千葉 花子，真鍋 法義，佐々木 雅人，内藤 淳子，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    日本薬学会第146年会、大阪、2026年3月、28-63-pm2-21S

  6. 3月

    哺乳細胞発現系を用いた組換えヒト・マウスDectin-1の修飾糖鎖の比較解析

    真鍋 法義，中野 総星，山田 有紗，佐藤 健太，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    日本薬学会第146年会、大阪、2026年3月、28-63-pm2-36

  7. 6月

    マトリグリカン十糖立体異性体の化学合成

    田口 遥斗，宮本 廉，小寺 康太，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    日本農芸化学会中四国支部例会、高知、2026年6月

  8. 6月

    タンパク質の立体構造データに基づいた疾患に関与する変異体予測システムの開発

    大野 詩歩

    令和8年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー、仙台、2026年6月、3

  9. 6月

    GlcNAc転移酵素の基質認識に関する構造生物学的研究

    長江 雅倫

    令和8年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー、仙台、2026年6月、4

  10. 6月

    ヒト酸性フォスファターゼACP3のN型糖鎖欠損バリアントの疾患との関連

    真鍋 法義

    令和8年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー、仙台、2026年6月、5

  11. 7月

    部位特異的コアフコシル化のメカニズム解明を目指した分子動力学計算

    大野 詩歩，後藤 優輝，真鍋 法義，山口 芳樹

    JHPCN: 学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点第18回シンポジウム、東京、2026年7月、EX26202

  12. 9月

    長鎖マトリグリカン誘導体の系統的合成と生理活性評価

    小寺 康太，宮本 廉，木下 貴明，真鍋 法義，安田 二朗，山口 芳樹，田村 純一

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、1A-E3

  13. 9月

    Peptide:N-グリカナーゼが有する非触媒ドメインの機能解析

    平山 弘人，立田 由里子，真鍋 法義，石井 希実，藤田 盛久，山口 芳樹，高橋 剛，松尾 一郎，鎌田 勝彦，Yann Guérardel，鈴木 匡

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、1C-04A

  14. 9月

    分子動力学計算によるO-マンノース型糖鎖とラミニンの鎖長依存的相互作用の解析

    大野 詩歩，佐々木 南波，真鍋 法義，山口 芳樹

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、2A-05B

  15. 9月

    糖鎖欠損ミスセンスバリアントの構造-機能解析：ACP3高マンノース型糖鎖の役割

    山口 芳樹，真鍋 法義，伊藤 和義，大野 詩歩，三浦 あゆみ，宮田 愛花，小松 祥子，藤村 務，花松 久寿，古川 潤一，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，秋元 義弘，要 匡，西原 祥子

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、3A-09A

  16. 9月

    Dectin-1によるβ-グルカン認識を規定する鎖長選択性と協調的オリゴマー形成

    真鍋 法義，兒玉 篤治，大崎 暁斗，千葉 花子，山口 祐希，Feng-Yueh Chan，加藤 晃一，内橋 貴之，内山 進，山口 芳樹

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、3B-02B

  17. 9月

    マトリグリカン立体異性体の合成とタンパク結合親和性

    田口 遥斗，小寺 康太，宮本 廉，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、PA-017

  18. 9月

    ヒトおよびマウスDectin-1における病的バリアントの発現特性と機能への影響

    千葉 花子，真鍋 法義，佐々木 雅人，大野 尚仁，山口 芳樹

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、PB-043

  19. 9月

    脳小血管病CADASIL関連変異によるNOTCH3のO型糖鎖修飾異常の解析

    田嶌 優子，足立 未来久，松石 鴻志，橋本 登，長江 雅倫，岡島 徹也

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、2C-02A

  20. 9月

    MGAT3の種依存的な活性と熱安定性

    鮑 婉雪，Anne Harduin-Lepers，長束 俊治，長江 雅倫，山﨑 貴大，岩澤 淳，木塚 康彦

    第45回日本糖質学会年会、福岡、2026年9月、PB-066

  21. 10月

    SIGLEC16遺伝子多型と神経変性疾患

    井ノ口 仁一，田高 周，稲森 啓一郎，新田 昂大，山口 芳樹，宍戸 史，栂谷内 晶，佐藤 ちひろ，羽根 正弥，下山 敦史，樺山 一哉，深瀬 浩一，木下 賢吾，山本 雅之，西原 祥子

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、O-1

  22. 10月

    EOGTの基質認識に関する構造生物学的研究

    長江 雅倫，田嶌 優子，岡島 徹也

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-2

  23. 10月

    放線菌由来L-ラムノース/D-ガラクトース特異的レクチンSHAの立体構造モデル構築および組換えタンパク質発現の試み

    畑山 慧汰，真鍋 法義，大野 詩歩，山口

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-17

  24. 10月

    レクチンによる多分岐N型糖鎖認識の構造生物学的解析

    國府 涼香，長江 雅倫，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-19

  25. 10月

    βグルカン結合に伴うDectin-1レクチンドメインの協調的オリゴマー形成の物理化学的解析

    千葉 花子，真鍋 法義，兒玉 篤治，大崎 暁斗，山口 祐希，Feng-Yueh Chan，加藤 晃一，内橋 貴之，内山 進，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-23

  26. 10月

    IgE修飾糖鎖の構造と機能的役割

    野村 桜子，澤田石 遥香，加茂 希萌，岩渕 立郎，真鍋 法義，上松 亮平，坂本 泉，廣瀬 賢治，權 垠相，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-24

  27. 10月

    低親和性IgE受容体CD23の糖鎖修飾の解析

    神山 優陽，野村 桜子，真鍋 法義，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-25

  28. 10月

    分子動力学計算によるO-マンノース型糖鎖とラミニンの鎖長依存的相互作用の解析

    大野 詩歩，佐々木 南波，真鍋 法義，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-26

  29. 10月

    BLI法によるマトリグリカンとラミニン相互作用の親和性評価

    宮本 廉，小寺 康太，田口 遥斗，田村 敬裕，望月 楽斗，大野 詩歩，真鍋 法義，田村 純一，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-27

  30. 10月

    ヒト酸性フォスファターゼACP3の修飾糖鎖が機能・構造安定性に果たす役割

    八島 空良，真鍋 法義，伊藤 和義，大野 詩歩，三浦 あゆみ，宮田 愛花，小松 祥子，藤村 務，花松 久寿，古川 潤一，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，秋元 義弘，要 匡，西原 祥子，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-28

  31. 10月

    ヒト酸性フォスファターゼACP3のN型糖鎖欠損バリアントの疾患との関連

    真鍋 法義，伊藤 和義，大野 詩歩，三浦 あゆみ，宮田 愛花，八島 空良，小松 祥子，藤村 務，花松 久寿，古川 潤一，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，秋元 義弘，要 匡，西原 祥子，山口 芳樹

    第20回東北糖鎖研究会、仙台、2026年10月、P-29

  32. 10月

    タンパク質の立体構造データに基づいた疾患に関与する変異体予測システムの開発

    大野 詩歩，小倉 千佳，矢吹 茜，伊藤 和義，真鍋 法義，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，古川 潤一，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子，山口 芳樹

    CBI学会2026年大会、東京、2026年10月、P05-04

2025年

論文・総説 13

  1. 3D structural insights into the effect of N-glycosylation in human chitotriosidase variant G102S

    Xiao Xu, Noriyoshi Manabe, Shiho Ohno, Sachiko Komatsu, Tsutomu Fujimura, Yoshiki Yamaguchi

    Biochim. Biophys. Acta (BBA) – Gen. Subj., 1869, 130730, 2025.DOI

    要旨

    キトトリオシダーゼ-1（CHIT1）は、ゴーシェ病のバイオマーカーとして利用されている。ある集団ではG102S変異が一般的であるが、このミスセンス変異がCHIT1の機能や病態に及ぼす影響は不明であった。我々は、G102S変異がCHIT1に及ぼす影響を調べた。その結果、N-グリコシル化がCHIT1の加水分解活性と構造ダイナミクスに与える影響に関する知見を得た。

  2. G-quadruplex-forming small RNA inhibits coronavirus and influenza A virus replication

    Ryoya Sekine, Kouki Takeda, Tsukasa Suenaga, Satsuki Tsuno, Takumi Kaiya, Maki Kiso, Seiya Yamayoshi, Yoshihide Takaku, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Seiichi Nishizawa, Kazuhiro Sumitomo, Kazufumi Ikuta, Teru Kanda, Yoshihiro Kawaoka, Hidekazu Nishimura, Shusuke Kuge

    Commun. Biol., 8(27), 2025.DOI

    要旨

    将来のパンデミックは、新型コロナウイルスやA型インフルエンザウイルスによって引き起こされる可能性がある。本研究では、12残基のグアニンRNA（G12）およびその誘導体（G12(S)）が、ウイルスの増殖を、通常の感染力の1/100から1/1000近くまで抑制することを示した。この手法は、汎用性の高い中間分子抗ウイルス剤の開発を促進する可能性を有する。

  3. Chemical extension and glycodendrimer formation of the matriglycan decasaccharide, -(3Xylα1-3GlcAβ1)5- and its affinity for laminin

    Kota Kotera, Ren Miyamoto, Gakuto Mochizuki, Takahiro Tamura, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Jun-ichi Tamura

    Carbohydr. Res., 547, 109328, 2025.DOI

    要旨

    筋組織はラミニンとマトリグリカンとの相互作用によって安定化される。筋ジストロフィー患者は、マトリグリカンやO-Man糖鎖を合成できない。したがって、マトリグリカンの供給は、これらの患者の筋肉組織を再構築する手段となり得る。本研究では、マトリグリカンを繰返し単位とする10糖類および、デンドリマー型糖鎖の合成と、これらのラミニンとの親和性を示した。

  4. VarMeter2: An enhanced structure-based method for predicting pathogenic missense variants through Mahalanobis distance

    Shiho Ohno, Chika Ogura, Akane Yabuki, Kazuyoshi Itoh, Noriyoshi Manabe, Kiyohiko Angata, Akira Togayachi, Kiyoko Aoki-Kinoshita, Jun-ichi Furukawa, Kei-ichiro Inamori, Jin-Ichi Inokuchi, Tadashi Kaname, Shoko Nishihara, Yoshiki Yamaguchi

    Comput. Struct. Biotechnol. J., 27, 1034-1047, 2025.DOI

    要旨

    ミスセンス変異の病原性を予測する様々な計算手法が開発されており、これは希少疾患の診断に極めて重要である。最近、我々はVarMeterを開発した。本研究では、その予測精度を高めるためVarMeter2を開発し、予測精度の検証を行った。これらの結果から、ミスセンス変異体の病原性を評価する上でVarMeter2の予測能力と汎用性が認められた。

  5. Complete assignment of 1H and 13C NMR signals of monoglucosylated high-mannose type glycan attached to asparagine

    Ryohei Uematsu, Izumi Sakamoto, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Carbohydr. Res., 552, 109468, 2025.DOI

    要旨

    Glc1Man9GlcNAc2（G1M9）糖鎖は、糖タンパク質合成の品質管理機構において重要な役割を果たす。カルネキシン（CNX）とカルレチキュリン（CRT）は、G1M9糖鎖を特異的に認識し、新規合成された糖タンパク質が正しく折り畳まれるのを助ける。本研究では、G1M9糖鎖の1Hおよび13Cシグナルの完全な帰属結果を示した。これにより、CNX/CRTとの相互作用に関する詳細な研究の基盤を提供し、糖タンパク質品質管理機構に関する理解を深める。

  6. Antagonistic effects of PU.1 on Gfi-1B-induced erythroid colony formation in human cord blood cells

    Noriyoshi Manabe, Takuya Sakurai, Fumiko Kihara-Negishi, Yosuke Nakazawa, Toshiyuki Yamada, Atsushi Iwama, Tsuneyuki Oikawa

    Cell. Mol. Biol. (Noisy-le-grand), 71(3), 48-56, 2025.DOI

    要旨

    Gfi-1Bは赤芽球/巨核球系細胞の成長と分化に必須の造血転写因子であり、PU.1は骨髄系分化のマスターレギュレーターである。本研究では、PU.1がGfi-1Bと生体内で相互作用することを実証した。我々の結果は、赤血球細胞の増殖と分化におけるGfi-1Bの機能が、PU.1の発現によって拮抗されることを示唆した。

  7. Bacterial expression, purification and characterization of the human Dectin-1 lectin domain for structural and functional studies

    Hanako Chiba, Noriyoshi Manabe, Junko Naito, Norihisa Nishida, Naohito Ohno, Yoshiki Yamaguchi

    Protein Expr, Purif., 229, 106668, 2025.DOI

    要旨

    Dectin-1（CLEC7A）はβ-1,3グルカンを認識するC型レクチン様受容体であり、自然免疫系において重要な役割を担う。本研究では、ヒトDectin-1レクチンドメインの大量発現系を開発した。この組換えタンパク質は、ヒトとマウスDectin-1におけるβ-グルカン結合特異性の差異、およびヒトDectin-1の機能性に対する変異の影響解明を目的とした構造生物学研究に貢献する。

  8. Analysis of CD22 cis-ligands using a synthetic sialoside binding to CD22 with ultra-high affinity

    Amin Alborzian Deh Sheikh, Wang Long, Naoko Matsubara, Takeshi Futamura, Akihiro Imamura, Hiromune Ando, Shiho Ohno, Hajjaj H.M. Abdu-Allah, Hiromu Takematsu, Masatake Asano, Yoshiki Yamaguchi, Hideharu Ishida, Takeshi Tsubata

    Carbohydr. Res., 554, 109519, 2025.DOI

    要旨

    CD22（Siglec-2）は、Bリンパ球に発現する抑制性受容体であり、α2,6-シアル化N-アセチルラクトサミンという糖鎖構造を認識する。本研究では、合成sialosideであるGSC-932を開発した。これにより、CD22とのシアル酸依存性結合を明確に識別でき、CD22が多様なリガンドと結合することが示された。GSC-932はCD22のリガンド相互作用研究に有用なツールとなり得る。

  9. VarMeter: a prediction method for the impact of glycogene variants

    Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Tadashi Kaname, Shoko Nishihara, Yoshiki Yamaguchi

    J. Hum. Genet., 2025.DOI

    要旨

    本総説では、構造情報を用いたミスセンス変異の影響予測に関する現行手法を議論し、3D構造パラメータを統合した計算フレームワークであるVarMeterや更新版のVarMeter2を紹介した。これらのツールは、これまで認識されていなかった糖鎖関連遺伝子の機能と疾患との関連性を解明する新たな道筋を提供し、遺伝的変異の臨床的解釈に貢献する。

  10. A gain-of-function PIK3CD variant, R512W, impairs T cell function through polyamine-dependent metabolic dysregulation

    Kyoko Kiyota, Hiroshi Shiraishi, Shiho Ohno, Yasuhiro Soga, Nobuyuki Shimizu, Hiroyuki Yatsuka, Masanori Inoue, Takashi Takeno, Wang Hongxia, Adiana Mutamsari Witaningrum, Reiko Hanada, Yoshiki Yamaguchi, Kenji Ihara, Toshikatsu Hanada

    Biochem. biophys. res. commun., 778, 152378, 2025.DOI

    要旨

    我々は以前、新規ヘテロ接合型PIK3CDのミスセンス変異（p.R512W）を持つ患者を報告した。本研究では、この患者に認められる表現型の分子メカニズムを解明するため、R512W変異体の機能的・構造的解析を実施した。その結果、異常なPI3Kシグナル伝達とポリアミン代謝の新たな関連性と、代謝経路を標的とすることが治療の潜在性を有する可能性を示唆した。

  11. Metabolic 13C-Labeling of IgA Fc Fragment by Transient Mammalian Expression for NMR Analysis

    Shunli Pan, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    NMR of Glycoproteins: Methods and Protocols, 2961, 69-75, 2025.DOI

    要旨

    糖鎖修飾タンパク質の原子レベルでの記述は、タンパク質糖鎖修飾の生理的役割を理解するために不可欠である。そこで溶液核磁気共鳴（NMR）分析は、糖鎖部分の立体構造と動的挙動を原子分解能で実験的に得られる点で唯一無二の手法である。本研究では、一過性の哺乳類発現系を用いた13C標識免疫グロブリンA（IgA）Fc断片の調製法を紹介した。

  12. Glycosylation of Tetraspanin CD151 Defines the Invasive Phenotype of Human Breast Cancer Cells

    Yuki Ohkawa, Yuanqin Yin, Miyako Nakano, Noriko Kanto, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Naoyuki Taniguchi

    FASEB J., 39, e71236, 2025.DOI

    要旨

    CD151はテトラスパニンファミリーに属する膜貫通糖タンパク質であり、インテグリンと複合体を形成する。我々はCD151のN-グリコシル化が細胞行動に果たす役割の解明を試みた。その結果、非糖鎖化型CD151の発現が癌細胞に浸潤性表現型を付与することを示唆しており、乳癌における転移を阻害する治療標的となり得ることを明らかとした。

  13. Monoclonal antibody-based assay to identify compounds that inhibit Nδ-(5-hydro-4-imidazolon-2-yl)ornithine (G-H1) formation

    Hikari Sugawa, Noriyoshi Manabe, Yoshitaka Hiraoka, Yoshiki Yamaguchi, Ryoji Nagai

    Glycoconj. J., 1-10, 2025.DOI

    要旨

    2型糖尿病における動脈硬化症の進行に伴い、糖化最終産物であるG-H1が蓄積する。そこで、本研究は、抗G-H1モノクローナル抗体を用いたG-H1阻害剤スクリーニングの実現可能性を明らかにすることを目的とした。その結果、抗G-H1モノクローナル抗体1E9が遊離G-H1を特異的に検出する可能性と、G-H1阻害剤スクリーニングにおけるその有用性を示した。

学会発表 37

  1. 2月

    Mechanisms of site-specific N-glycosylation: experimental and computational approaches

    Yoshiki Yamaguchi

    AS-TMPU meeting、Taipei、2025年2月

  2. 3月

    マトリグリカン十糖とそのグリコデンドリマーの化学合成とラミニン結合親和性評価

    小寺 康太，宮本 廉，望月 楽斗，田村 敬裕，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    日本農芸化学会2025年大会、札幌、2025年3月、3H014

  3. 3月

    Fmoc-Asn G1M9を対象とした1H及び13C NMRシグナルの完全帰属

    上松 亮平，橋本 奈央子，坂本 泉，吉田 慎一朗，真鍋 法義，金谷 章生，權 垠相，山口 芳樹

    日本薬学会第145年会、福岡、2025年3月、27-17-am07

  4. 3月

    レクチン様受容体Dectin-1の不溶性βグルカン結合アッセイを用いた各種パラミロンの機能性評価

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    日本薬学会第145年会、福岡、2025年3月、27P-am361S

  5. 3月

    哺乳細胞による組換えDectin-1の発現とその修飾糖鎖ならびにβグルカン結合能の解析

    真鍋 法義，中野 総星，山田 有紗，佐藤 健太，山口 芳樹

    日本薬学会第145年会、福岡、2025年3月、28-10-am11

  6. 5月

    Site-specific processing of core fucosylation in N-Glycans: A structural perspective

    Yoshiki Yamaguchi, Shiho Ohno, Yuki Goto, Noriyoshi Manabe

    The 27th International Glycoconjugate Symposium, Canada, 2025年5月

  7. 5月

    Recombinant expression and characterization of human and mouse Dectin-1 lectin domains: Unraveling the unique β-glucan binding mechanism

    Hanako Chiba, Noriyoshi Manabe, Junko Naito, Norihisa Nishida, Naohito Ohno, Yoshiki Yamaguchi

    The 27th International Glycoconjugate Symposium, Canada, 2025年5月

  8. 5月

    Glyco-redox - the roles in various diseases under oxidative stress

    Naoyuki Taniguchi, Yuki Ohkawa, Motoko Takahashib and Yoshiki Yamaguchi

    The 27th International Glycoconjugate Symposium, Canada, 2025年5月、D4A2

  9. 6月

    病原性予測法 VarMeter2 の開発と応用：SGSH 変異 Q365P による酵素失活の構造生化学的検証

    大野 詩歩，小倉 千佳，矢吹 茜，伊藤 和義，真鍋 法義，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，古川 潤一，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子，山口 芳樹

    第91回日本生化学会東北支部例会、仙台、2025年6月、O-8

  10. 6月

    構造解析を指向したヒト Dectin-1 レクチンドメインの大量発現とその性状解析

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    第91回日本生化学会東北支部例会、仙台、2025年6月、P-2

  11. 6月

    合成マトリグリカンの構造とラミニン親和性の相関：BLI 法による解析

    宮本 廉，小寺 康太，田口 遥斗，田村 敬裕，望月 楽斗，湊谷 敬太，伊藤 良汰，真鍋 法義，田村 純一，山口 芳樹

    第91回日本生化学会東北支部例会、仙台、2025年6月、P-16

  12. 6月

    ヒト IgE-Fc における高マンノース型糖鎖の構造と機能的役割の解明

    野村 桜子，澤田石 遥香，加茂 希萌，岩渕 立郎，真鍋 法義，上松 亮平，坂本 泉，廣瀬 賢治，權 垠相，山口 芳樹

    第91回日本生化学会東北支部例会、仙台、2025年6月、P-22

  13. 6月

    哺乳細胞による組換え Dectin-1 の発現とその修飾糖鎖の解析

    真鍋 法義，中野 総星，山田 有紗，佐藤 健太，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第91回日本生化学会東北支部例会、仙台、2025年6月、P-46

  14. 6月

    哺乳細胞による組換えDectin-1の発現とその修飾糖鎖の解析

    真鍋 法義

    令和7年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー、仙台、2025年6月

  15. 7月

    Chemical extension and glycodendrimer formation of the matriglycan decasaccharide, -(3Xylα1-3GlcAβ1)5- and its affinity for laminin

    Jun-ichi Tamura, Kota Kotera, Ren Miyamoto, Gakuto Mochizuki, Takahiro Tamura, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    The 22nd European Carbohydrate Symposium, Poland，2025年7月

  16. 9月

    Uncovering Glycoprotein Dynamics: Structural and Functional Insights Beyond the Static Snapshot

    Yoshiki Yamaguchi

    CECAM workshop “The Dual Nature of Glycans in Protein-Protein Interactions; Bridging Computational and Experimental Insights”, Italy，2025年9月

  17. 10月

    マトリグリカン立体異性体の立体選択的合成と受容体親和性

    田口 遥斗，小寺 康太，宮本 廉，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、1B-05B

  18. 10月

    全国の診断困難な糖鎖関連希少疾患患者に対する診断連携：糖鎖関連未診断・希少疾患同定プラットフォーム

    要 匡，古川 潤一，栂谷内 晶，安形 清彦，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，北川 裕之，木下 聖子，山口 芳樹，西原 祥子

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、1C-01A

  19. 10月

    ミスセンスバリアントの病原性予測法 VarMeter2 の開発とその糖鎖関連遺伝子への応用

    山口 芳樹，大野 詩歩，小倉 千佳，矢吹 茜，伊藤 和義，真鍋 法義，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，古川 潤一，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、1C-02A

  20. 10月

    SIGLEC16 遺伝子多型と神経変性疾患発症リスクの関連解析

    井ノ口 仁一，田高 周，稲森 啓一郎，新田 昂大，山口 芳樹，西原 祥子，木下 聖子，栂谷内 晶，安形 清彦，佐藤 ちひろ，羽根 正弥，古川 潤一，山本 雅之，木下 賢吾

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、1C-05A

  21. 10月

    哺乳細胞発現系を用いたヒト・マウス Dectin-1 の糖鎖修飾の比較解析

    真鍋 法義，中野 総星，山田 有紗，佐藤 健太，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、1B-13B

  22. 10月

    マトリグリカン誘導体の合成と受容体親和性

    小寺 康太，宮本 廉，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PA-32

  23. 10月

    ヒト IgE-Fc に修飾される高マンノース型糖鎖の構造と機能的役割の解析

    野村 桜子，澤田石 遥香，加茂 希萌，岩渕 立郎，真鍋 法義，上松 亮平，坂本 泉，廣瀬 賢治，權 垠相，山口 芳樹

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PA-36

  24. 10月

    細胞質 Peptide:N-glycanase がもつ非触媒ドメインの機能についての解析

    平山 弘人，立田 由里子，藤田 盛久，真鍋 法義，山口 芳樹，石井 希実，高橋 剛，松尾 一郎，鎌田 勝彦，鈴木 匡

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PE-05

  25. 10月

    Fmoc 保護糖アミノ酸で観測される化学交換の NMR 解析

    上松 亮平，橋本 奈央子，坂本 泉，吉田 慎一朗，真鍋 法義，金谷 章生，權 垠相，山口 芳樹

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PG-26

  26. 10月

    ヒトおよびマウス Dectin-1 によるβ- グルカン認識機構の比較解析

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PA-56

  27. 10月

    BLI 法を用いたマトリグリカン鎖長依存的ラミニン結合の速度論的解析

    宮本 廉，小寺 康太，田口 遥斗，田村 敬裕，望月 楽斗，大野 詩歩，真鍋 法義，田村 純一，山口 芳樹

    第44回日本糖質学会年会、弘前、2025年10月、PA-65

  28. 11月

    SIGLEC16遺伝子多型に基づく神経変性疾患発症リスクの診断と治療法の可能性

    井ノ口 仁一，田高 周，稲森 啓一郎，新田 昂大，山口 芳樹，西原 祥子，木下 聖子，栂谷内 晶，安形 清彦，佐藤 ちひろ，羽根 正弥，古川 潤一，山本 雅之，木下 賢吾

    第98回日本生化学会大会、京都、2025年11月、1P-017

  29. 11月

    立体構造に基づくミスセンスバリアントの病原性予測法VarMeter2の開発とその応用

    山口 芳樹，大野 詩歩，小倉 千佳，矢吹 茜，伊藤 和義，真鍋 法義，安形 清彦，栂谷内 晶，木下 聖子，古川 潤一，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子

    第98回日本生化学会大会、京都、2025年11月、3P-343

  30. 11月

    Structure-Based Prediction of Pathogenic Glycogene Variants Using VarMeter2

    Yoshiki Yamaguchi, Shiho Ohno, Chika Ogura, Akane Yabuki, Kazuyoshi Itoh, Noriyoshi Manabe, Kiyohiko Angata, Akira Togayachi, Kiyoko Aoki-Kinoshita, Jun-ichi Furukawa, Kei-ichiro Inamori, Jin-Ichi Inokuchi, Tadashi Kaname, Shoko Nishihara

    2025 Annual Meeting of the Society for Glycobiology、サンディエゴ、2025年11月

  31. 11月

    Association between SIGLEC16 gene polymorphisms and the risk of neurodegenerative diseases

    Jinichi Inokuchi, Shu Tadaka, Kei-ichiro Inamori, Takahiro Nitta, Yoshiki Yamaguchi, Shoko Nishihara, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Akira Togayachi, Kiyohiko Angata, Chihiro Sato, Masaya Hane, Jun-ichi Furukawa, Masayuki Yamamoto, Kengo Kinoshita

    2025 Annual Meeting of the Society for Glycobiology、サンディエゴ、2025年11月、B3-043

  32. 11月

    糖タンパク質のダイナミクスから構造・機能の理解に向けて

    山口 芳樹

    医薬工研究連携キックオフセミナー、仙台、2025年11月

  33. 11月

    組換えヒト・マウスDectin-1の修飾糖鎖の比較解析

    真鍋 法義，中野 総星，山田 有紗，佐藤 健太，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第19回東北糖鎖研究会、新潟、2025年11月

  34. 11月

    放線菌由来l-ラムノース/d-ガラクトース特異的レクチンSHAの立体構造モデル構築および組換えタンパク質発現の試み

    畑山 慧汰，真鍋 法義，大野 詩歩，山口(藤田) 陽子，山口 芳樹

    第19回東北糖鎖研究会、新潟、2025年11月

  35. 11月

    ヒトDectin-1病的バリアントの発現特性と機能的影響

    千葉 花子，真鍋 法義，佐々木 雅人，内藤 淳子，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    第9回東北医真菌研究会、山形、2025年11月

  36. 12月

    ヒトIgE-Fcにおける高マンノース型糖鎖の組み合わせと機能的役割の解明

    野村 桜子，澤田石 遥香，加茂 希萌，岩渕 立郎，真鍋 法義，上松 亮平，坂本 泉，廣瀬 賢治，權 垠相，山口 芳樹

    第4回日本抗体学会学術大会、大宮、2025年12月、A008

  37. 12月

    ヒトIgA1-Fcの二量体形成および安定性に対するN-型糖鎖の部位特異的役割

    山口 芳樹，Shunli Pan，真鍋 法義，大野 詩歩，小松 祥子，藤村 務

    第4回日本抗体学会学術大会、大宮、2025年12月、B009

2024年

論文・総説 12

  1. Exogenous l-fucose attenuates neuroinflammation induced by lipopolysaccharide

    Xing Xu, Tomohiko Fukuda, Jun Takai, Sayaka Morii, Yuhan Sun, Jianwei Liu, Shiho Ohno, Tomoya Isaji, Yoshiki Yamaguchi, Miyako Nakano, Takashi Moriguchi, Jianguo Gu

    J. Biol. Chem., 300, 105513 (2024)DOI

    要旨

    N-型糖鎖修飾を受けたIL-6/sIL-6R/gp130複合体の3D構造モデルを構築し，N-型糖鎖修飾の立体構造的および機能的役割についての考察を行った．

  2. Each N-glycan on human IgA and J-chain uniquely affects oligomericity and stability

    Shunli Pan, Noriyoshi Manabe, Shiho Ohno, Sachiko Komatsu, Tsutomu Fujimura, Yoshiki Yamaguchi

    Biochim. Biophys. Acta (BBA) – Gen. Subj., 1868, 130536 (2024)DOI

    要旨

    免疫グロブリンA（IgA）は，様々な免疫応答，特に粘膜免疫において重要な役割を果たしている．IgAは通常，J鎖の寄与により二量体に組み立てられる．ヒトIgA1-Fcには2つのN-型糖鎖付加部位があり，J鎖には1つある．各N-型糖鎖の機能的役割を理解するために，一連のIgA1-Fc変異体を用いて実験を行った．その結果，IgA1-FcのN459の糖鎖は二量体形成および高次凝集体の防止に必須であり，一方，N263（Fc）およびN49（J鎖）の糖鎖はFc-J鎖複合体を安定化させると結論付けた．

  3. Prediction of protein structure and AI

    Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    J. Hum.Genet. 69, 477-480 (2024)DOI

    要旨

    AlphaFoldは，タンパク質の3次元構造モデルから構造-機能相関を理解するのに有用であり，X線結晶構造解析，NMR，クライオ電子顕微鏡解析などの実験的構造解析のテンプレートやリファレンスとして機能する．その利用は，構造生物学のみならず，他の研究分野においても研究者の間で広がりつつある．ミスセンス変異による疾患の重症度予測もそのような応用の一つである．本稿では，ディープラーニング技術に基づくAlphaFoldの3次元構造モデリングの概要を紹介し，ミスセンス変異の病原性予測における課題を述べた．

  4. A convenient assay for soluble Dectin-1 lectin domain binding to insoluble β-glucans

    Hanako Chiba, Noriyoshi Manabe, Junko Naito, Norihisa Nishida, Naohito Ohno, Yoshiki Yamaguchi

    Carbohydr. Res., 536, 109041 (2024)DOI

    要旨

    β-グルカンは，β-1,3結合したグルコース残基を骨格とするホモポリマーである．β-グルカンの溶解度と生物学的活性は，骨格の長さとβ-1,6分岐の長さ／間隔によって影響を受ける．Dectin-1は，外来性βグルカンとの結合を通して自然免疫に重要な役割を果たしている．しかしながら，定量的な結合親和性解析例はほとんどなく，Dectin-1と不溶性β-グルカンとの結合に関する包括的な比較解析はなされていない．我々は，Dectin-1レクチンドメインと不溶性β-グルカンとの相互作用に関する簡便な結合アッセイ法を開発した．

  5. NMR characterization of uniformly 13C‐ and/or 15N‐labeled, unsulfated chondroitins with high molecular weights

    Megumi Ichikawa, Yuya Otsuka, Toshikazu Minamisawa, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Magn. Reson. Chem., 62, 439-451 (2024)DOI

    要旨

    多糖類の溶液NMR分析は，その化学構造だけでなく，生理的条件下でのコンフォメーション，ダイナミクス，相互作用に関する貴重な情報を提供する．主な問題の一つは，非アノマーの1Hシグナルが重なり合うことであり，これがしばしば詳細なNMR分析の妨げとなる．13Cや15Nのような安定同位体標識は，多糖類のNMRスペクトルに新たな次元を加えることになり，分離されたピークを用いることでスペクトル解析をより高い感度で行うことができる．我々はバクテリアの培養によって均一に13C・15N標識したコンドロイチンを調製した．1Hおよび13C NMRシグナルは主にHSQCおよびINADEQUATE，HETCOR，HETCOR-TOCSYを含む13C直接検出実験に基づいて帰属した．N-アセチル-β-d-ガラクトサミン残基のカルボニル炭素シグナルは，13Cおよび15Nの２重標識コンドロイチンの1JCNカップリングによる13Cピーク分裂の観察により，β-d-グルクロン酸残基のC6炭素と明確に区別された．13C緩和時間の測定から，コンドロイチンの長い配列にrigidな部位とflexibleな部位の両方が存在することが示された．

  6. Solution NMR analysis of O-glycopeptide-antibody interaction

    Ryoka Kokubu, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Methods Mol. Biol. 2763, 321-327 (2024)DOI

    要旨

    O-型糖鎖は，細胞認識のイベントにおいて機能的な役割を果たす可能性がある．最近の構造解析によると，O-型糖鎖はレクチン受容体の特異的シグナルとなり，O-型糖鎖と隣接するポリペプチド領域の両方を認識することが示唆されている．さらに，ある種の抗体はO-型糖ペプチドに特異的に結合する．タンパク質上のO-型糖鎖がレクチンや抗体によって特異的に認識されるメカニズムに関心が高まっているが，糖鎖とタンパク質の二重認識に関する3次元構造情報は限られている．本章では，MUC1 O-型糖ペプチドと抗MUC1抗体MY.1E12との相互作用の溶液NMR解析について述べている．

  7. Molecular dynamics simulation and docking of MUC1 O-Glycopeptide

    Ryoka Kokubu, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi

    Methods Mol. Biol. 2763, 373-379 (2024)DOI

    要旨

    分子動力学（MD）シミュレーションは，遊離糖鎖や糖ペプチドのような柔軟な生体分子のコンフォメーション，ダイナミクス，相互作用の研究に特に適している．コンピュータシミュレーションは，適切なパラメータ設定のもとで行われる必要があり，その結果は検証される必要がある．本章では，MUC1 O-型糖ペプチドの分子動力学シミュレーションと抗MUC1抗体Fvフラグメントとのドッキングの例を紹介している．

  8. Comparative conformational analysis of acyclic sugar alcohols ribitol, xylitol and d-arabitol by solution NMR and molecular dynamics simulations

    Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Jun Uzawa, Yoshiki Yamaguchi

    Molecules, 29, 1072 (2024)DOI

    要旨

    リビトール（C5H12O5）は非環式糖アルコールであり，最近哺乳類のα-ジストログリカン上のO-マンノース糖鎖に同定された．リビトールのような非環式糖アルコールのコンフォメーションとダイナミクスは，水酸基の立体化学に依存しているが，そのダイナミクスは完全には理解されていない．我々は，糖アルコールの立体構造とダイナミクスを明らかにするために，リビトール，d-アラビトール，キシリトールの結晶構造データベース検索，溶液NMR解析，分子動力学（MD）シミュレーションによる比較解析を行った．実験データと計算データを総合すると，リビトールはd-アラビトールやキシリトールよりも柔軟であり，その柔軟性の少なくとも一部は，分子内水素結合を形成する可能性のあるOH基の配置によって規定されると結論した．

  9. Imaging α-synuclein pathologies in animal models and patients with Parkinson’s and related diseases

    Hironobu Endo, Maiko Ono, Yuhei Takado, Kiwamu Matsuoka, Manami Takahashi, Kenji Tagai, Yuko Kataoka, Kosei Hirata, Keisuke Takahata, Chie Seki, Naomi Kokubo, Masayuki Fujinaga, Wakana Mori, Yuji Nagai, Koki Mimura, Katsushi Kumata, Tatsuya Kikuchi, Aki Shimozawa, Sushil K. Mishra, Yoshiki Yamaguchi, Hiroshi Shimizu, Akiyoshi Kakita, Hiroyuki Takuwa, Hitoshi Shinotoh, Hitoshi Shimada, Yasuyuki Kimura, Masanori Ichise, Tetsuya Suhara, Takafumi Minamimoto, Naruhiko Sahara, Kazunori Kawamura, Ming-Rong Zhang, Masato Hasegawa, Makoto Higuchi

    Neuron, 112, 2540-2557.e8 (2024)DOI

    要旨

    α-シヌクレイン線維の沈着はパーキンソン病やレビー小体型認知症に関与しているが，これらの疾患におけるα-シヌクレインの病態をin vivoで検出することは困難であった．そこで生きた被験者の脳内に沈着したα-シヌクレインを可視化する低分子リガンドC05-05が開発された．我々はC05-05，PM-PBB3, PBB3とα-シヌクレイン線維とのドッキングシミュレーションおよび分子動力学計算を通じた結合親和性の計算を担当し，結合特異性に対する立体構造的な考察を行った．

  10. Functional evaluation of novel variants of B4GALNT1 in a patient with hereditary spastic paraplegia and the general population

    Kei-ichiro Inamori, Katsuya Nakamura, Fumi Shishido, Jia-Chen Hsu, Masakazu Nagafuku, Takahiro Nitta, Junji Ikeda, Hidekane Yoshimura, Minori Kodaira, Naomi Tsuchida, Naomichi Matsumoto, Satoshi Uemura, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Akira Togayachi, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Shoko Nishihara, Jun-ichi Furukawa, Tadashi Kaname, Masahiko Nakamura, Takayoshi Shimohata, Shu Tadaka, Matsuyuki Shirota, Kengo Kinoshita, Yutaka Nakamura, Isao Ohno, Yoshiki Sekijima, Jin-ichi Inokuchi

    Front. Neurosci. 18 (2024)DOI

    要旨

    B4GALNT1のホモ接合ミスセンス変異体p.Asp313Asnがタンパク質の機能に及ぼす影響を予測するために，ホモロジーモデリングによりヒトB4GALNT1（GM2S）の触媒ドメインの3Dモデルを構築した．類縁タンパク質の立体構造との比較を行った結果，B4GALNT1 の Asp313 は UDP の結合部位であることが予想された．従って，B4GALNT1のAsp313はドナー基質UDP-GalNAcの結合に関与していると予想され，p.Asp313Asn変異体の酵素活性はドナー結合の消失により損なわれると考察した．

  11. Systematic preparation of a 66-IgG library with symmetric and asymmetric homogeneous glycans and their functional evaluation

    Shino Manabe, Shogo Iwamoto, Satoru Nagatoishi, Asako Hoshinoo, Ai Mitani, Wataru Sumiyoshi, Takashi Kinoshita, Yoshiki Yamaguchi, Kouhei Tsumoto

    J. Am. Chem. Soc., 146, 23426-23436 (2024)DOI

    要旨

    免疫グロブリンG（IgG）抗体は，Fcドメインに保存されたN-グリコシル化部位を持っている．FcγRIIIaアフィニティーカラムクロマトグラフィーでは，非グリコシル化，ヘミグリコシル化，完全グリコシル化IgGの保持時間はかなり異なる．保持時間の違いを利用して，対称型および非対称型の均一糖鎖を持つ66種類のトラスツズマブ抗体を系統的に調製し，均一糖鎖を持つIgGの範囲を大幅に拡大した．

  12. Theoretical framework for novel catalytic biomolecules composed of multiple peptides

    Akihiro Ambo, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Masayuki Seki

    Chem. Pharm. Bull., 72, 804-809 (2024)DOI

    要旨

    ピルビン酸キナーゼから抽出したβ-バレル構造と基盤となる環状ペプチドからなるOctopuzymeの立体構造モデルの構築を担当した．ピルビン酸キナーゼ活性部位のβ-バレルに対応する8個のペプチドに対して分子動力学（MD）シミュレーションを行い，足場となるGKリングを8個のペプチドに結合させた．

学会発表 28

  1. 4月

    筋ジストロフィー症に関係するO-マンノース型糖鎖の構造と機能に関する研究

    山口 芳樹

    新分子生体膜研究所キックオフセミナー，仙台，2024年4月，演題番号7

  2. 5月

    ヒトIgAおよびJ鎖を修飾するN-結合型糖鎖の構造と機能

    潘 順麗，真鍋 法義，大野 詩歩，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第90回日本生化学会東北支部例会，秋田，2024年5月，演題番号P-3

  3. 7月

    分子動力学計算を用いた新規未分化iPS細胞抗体デザイン

    大野 詩歩，田岡 千拓，大内 陽翔，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点 第16回 シンポジウム，東京，2024年7月

  4. 8月

    外因性病原体が有する多様なβグルカン構造を認識するDectin-1受容体の分子メカニズムの解明

    真鍋 法義

    令和6年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー，仙台，2024年8月

  5. 8月

    筋ジストロフィーを制御するO-マンノース型糖鎖の構造生物学的研究

    大野 詩歩

    令和6年度東北医科薬科大学研究・症例セミナー，仙台，2024年8月

  6. 8月

    新規機能性食品素材パラミロンの加熱加工に対する安定性

    内藤 淳子，千葉 花子，真鍋 法義，西田 典永，大野 尚仁，山口 芳樹

    第71回日本食品科学工学会，名古屋，2024年8月，3Fp-08

  7. 9月

    部位特異的コアフコシル化のメカニズム解明を目指した分子動力学計算

    後藤 優輝，大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    第43回日本糖質学会年会，横浜，2024年9月，演題番号3A-01A

  8. 9月

    マトリグリカン複合糖質の合成とラミニン結合親和性評価

    小寺 康太，宮本 廉，田村 敬裕，望月 楽斗，真鍋 法義，山口 芳樹，田村 純一

    第43回日本糖質学会年会，横浜，2024年9月，1B-02B

  9. 9月

    ガングリオシド生合成酵素の新規バリアントの機能解析

    稲森 啓一郎，宍戸 史，山口 芳樹，木下 賢吾，西原 祥子，井ノ口 仁一

    第43回日本糖質学会年会，横浜，2024年9月，3C-07B

  10. 9月

    NMR法による均一13C/15N標識コンドロイチンの構造解析

    市川 めぐみ，大塚 祐也，南澤 俊和，真鍋 法義，山口 芳樹

    第43回日本糖質学会年会，横浜，2024年9月，P-028

  11. 9月

    マンノースリン酸イソメラーゼによる中心代謝の制御機構の解明に向けて

    原田 陽一郎，平山 明由，池田 五月，真鍋 法義，栗原 大輝，藤田 晶大，長江 雅倫，木下 聖子，山口 芳樹，東山 繁樹，谷口 直之

    第43回日本糖質学会年会，横浜，2024年9月，P-039

  12. 10月

    日本人におけるSIGLEC ファミリー遺伝子多型と発症リスク

    井ノ口 仁一，稲森 啓一郎，山口 芳樹，田高 周，木下 賢吾，山本 雅之，西原 祥子，木下 聖子，栂谷内 晶，安形 清彦，佐藤 ちひろ，羽根 正弥，古川 潤一，石田 秀治，矢木 宏和

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号O-1

  13. 10月

    ガングリオシド生合成に関わる糖転移酵素の新規ミスセンスバリアントの機能的評価

    稲森 啓一郎，宍戸 史，山口 芳樹，木下 賢吾，西原 祥子，井ノ口 仁一

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号O-2

  14. 10月

    糖鎖均一抗体トラスツズマブの作製とADCC，熱安定性測定

    眞鍋 史乃，岩本 将吾，長門石 曉，星野尾 麻子，三谷 藍，住吉渉，木下 崇司，山口 芳樹，津本 浩平

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号O-4

  15. 10月

    分子動力学計算とNMR 法によるlacto-N-fucopenaose I と抗体の複合体モデル構築

    大野 詩歩，田岡 千拓，大内 陽翔，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号O-5

  16. 10月

    Dectin-1 のリガンド結合指向性とオリゴマー形成過程の解析

    真鍋 法義，大崎 暁斗，兒玉 篤治，山口 祐希，内山 進，内橋 貴之，加藤 晃一，山口 芳樹

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号O-6

  17. 10月

    ヒトキトトリオシダーゼバリアント G102S におけるN-グリコシル化の立体構造的影響

    徐 瀟，真鍋 法義，大野 詩歩，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号P-6

  18. 10月

    IgE-Fc の糖鎖修飾とその構造的役割

    野村 桜子，澤田石 遥香，加茂 希萌，岩渕 立郎，真鍋 法義，上松 亮平，坂本 泉，廣瀬 賢治，權 垠相，山口 芳樹

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号P-13

  19. 10月

    BLI 法によるマトリグリカンとラミニンの相互作用の親和性評価

    宮本 廉，湊谷 敬太，伊藤 良汰，真鍋 法義，小寺 康太，田村 敬裕，望月 楽斗，田村 純一，山口 芳樹

    第18 回東北糖鎖研究会，仙台，2024年10月，演題番号P-15

  20. 10月

    糖鎖の可視化技術の現状と展望

    山口 芳樹

    第6回糖鎖技術開発セミナー，オンライン，2024年10月，演題番号1

  21. 11月

    VarMeter2:タンパク質の立体構造データに基づくミスセンスバリアントの重篤度予測

    山口 芳樹，矢吹 茜，大野 詩歩，真鍋 法義，古川 潤一，栂谷内 晶，木下 聖子，安形 清彦，井ノ口 仁一，要 匡，西原 祥子

    第97回日本生化学会大会，横浜，2024年11月，演題番号2S11e-04

  22. 11月

    細胞質Peptide:N-glycanaseが持つ非触媒ドメインの機能についての再検証

    平山 弘人，立田 由里子，藤田 盛久，真鍋 法義，山口 芳樹，鈴木 匡

    第97回日本生化学会大会，横浜，2024年11月，2S09e-01

  23. 11月

    出芽酵母におけるカルシウム依存性の複合型スフィンゴ脂質クラスター形成

    紀平 怜，上村 聡志，大野 詩歩，山口 芳樹，森口 尚

    第97回日本生化学会大会，横浜，2024年11月，1P-007

  24. 11月

    ヒトポリシアル酸転移酵素における新規疾患関連モチーフの発見

    畑中 理菜，羽根 正弥，早川 開都，森下 沙世，大野 詩歩，山口 芳樹，呉 迪，北島 健，佐藤 ちひろ

    第97回日本生化学会大会，横浜，2024年11月，3P-017

  25. 12月

    「糖鎖構造構造生物学」による糖鎖構造多様性の生物学的意義の探求

    山口 芳樹

    第1回GlyCosmosシンポジウム，つくば，2024年12月，演題番号3

  26. 12月

    抗体の糖鎖修飾とその構造・機能的役割

    山口 芳樹

    第3回日本抗体学会学術大会，仙台，2024年12月

  27. 12月

    組換えDectin-1の哺乳細胞による発現と修飾糖鎖およびβグルカン結合能の解析

    真鍋 法義，中野 総星，佐藤 健太，山田 有紗，山口 芳樹

    第8回東北医真菌研究会東北支部会，仙台，2024年12月

  28. 12月

    抗体の基本構造と糖鎖修飾を利用した均一ADCの合成

    山口 芳樹

    サイエンス＆テクノロジーセミナー，オンライン，2024年12月

2023年

論文・総説 2

  1. Identification of a buried β-strand as a novel disease-related motif in the human polysialyltransferases

    Rina Hatanaka, Masaya Hane, Kaito Hayakawa, Sayo Morishita, Shiho Ohno, Yoshiki Yamaguchi, Di Wu, Ken Kitajima, Chihiro Sato

    J. Biol. Chem., 300, 105564 (2023)DOI

    要旨

    ポリシアル酸転移酵素ST8SIA2およびST8SIA4とその産物であるポリシアル酸（ポリシアル酸）は，癌や精神疾患に関連することが知られている．ポリシアル酸転移酵素に見出された新しい病原性モチーフ（Pモチーフ）に対して，各Ala変異体の変異エネルギー計算を実施し，Pモチーフ変異体の酵素安定性を評価した．その結果，コンフォメーションエネルギーのわずかな違いが活性を規定していることが明らかになった．

  2. Structural analysis of oligosaccharides and glycoconjugates using NMR

    Yoshiki Yamaguchi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato

    Adv. Neurobiol., 29, 163-184 (2023)

学会発表 15

  1. 3月

    レクチン受容体Dectin-1の不溶性βグルカン結合における構造特異性

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，髙橋 円，大野 尚仁，山口 芳樹

    日本薬学会第143年会，北海道，2023年3月，演題番号26P1-pm1-089S

  2. 5月

    イオンモビリティー質量分析法によるピリジルアミノ化糖鎖の異性体識別

    真鍋 法義，大野 詩歩，川瀬 泰司，廣瀬 賢治，益田 勝吉，山口 芳樹

    第71回質量分析総合討論会，大阪，2023年5月，演題番号3B-O-1027

  3. 6月

    分子動力学計算によるO-マンノース糖鎖の動的構造および相互作用の解析

    大野 詩歩，佐々木 南波，湊谷 敬太，真鍋 法義，山口 芳樹

    日本生化学会東北支部第89回例会シンポジウム，仙台，2023年6月，要旨集p.29

  4. 8月

    Glycan dynamics and glycan-protein interactions analyzed by experimental NMR methods, AlphaFold-assisted molecular dynamics and docking simulations

    Yoshiki Yamaguchi

    Glyco26, Taipei, Aug. 2023, 演題番号C074

  5. 8月

    Ion mobility mass spectrometry analysis of 71 pyridylaminated N-linked oligosaccharides for database construction

    Noriyoshi Manabe, Shiho Ohno, Taiji Kawase, Kenji Hirose, Katsuyoshi Masuda, and Yoshiki Yamaguchi

    Glyco26, Taipei, Aug. 2023, 演題番号C061

  6. 10月

    O-マンノース糖鎖を構成するリビトールおよびその類縁体のダイナミクス解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    第62回日本薬学会東北支部大会，仙台，2023年10月，要旨集p.17

  7. 10月

    ヒト免疫グロブリン A1 の Fc 結合糖鎖の構造と機能

    潘 順麗，真鍋 法義，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第62回日本薬学会東北支部大会，仙台，2023年10月，要旨集p.17

  8. 10月

    糖転移酵素GnT-IIIのニューロンにおける生理機能の解明

    橋本 雄太，山口 瞬，山口 芳樹，木塚 康彦

    第96回日本生化学会大会日本生化学会，福岡，2023年10月，演題番号1T02a-07(1P-034)

  9. 10月

    遺伝性痙性対麻痺SPG26原因遺伝子B4GALNT1の新規変異およびバリアントの機能解析

    稲森 啓一郎，宍戸 史，許 家甄，永福 正和，新田 昂大，中村 勝哉，土田 奈緒美，池田 淳司，小平 農，栂谷内 晶，古川 潤一，山口 芳樹，木下 聖子，要 匡，中村 豊，大野 勲，中村 雅彦，下畑 享良，松本 直通，古庄 知己，関島 良樹，木下 賢吾，西原 祥子，井ノ口 仁一

    第96回日本生化学会大会日本生化学会，福岡，2023年10月，演題番号1P-035

  10. 10月

    エストロゲンによる唾液腺細胞由来糖タンパク質の糖鎖修飾の変化

    中嶋 菜南子，相川 京子，村松 敬，山口 芳樹，グホ サビン

    第96回日本生化学会大会日本生化学会，福岡，2023年10月，演題番号2P-008

  11. 11月

    ヒトIgAおよびJ 鎖を修飾するN-結合型糖鎖の構造と機能

    潘 順麗，真鍋 法義，小松 祥子，藤村 務，山口 芳樹

    第17 回東北糖鎖研究会，群馬，2023年11月，O-1

  12. 11月

    Dectin-1レクチンドメインの大量発現およびβグルカンとの結合試験

    真鍋 法義，山口 芳樹

    第17 回東北糖鎖研究会，群馬，2023年11月，演題番号O-9

  13. 11月

    遺伝性痙性対麻痺患者における新規B4GALNT1変異および一般住民にみられるバリアントの機能評価

    許 家甄，稲森 啓一郎，宍戸 史，永福 正和，新田 昂大，中村 勝哉，土田 奈緒美，池田 淳司，小平 農，栂谷内 晶，古川 潤一，山口 芳樹，木下 聖子，要 匡，中村 豊，大野 勲，中村 雅彦，下畑 享良，松本 直通，古庄 知巳，関島 良樹，木下 賢吾，西原 祥子，井ノ口 仁一

    第17 回東北糖鎖研究会，群馬，2023年11月，P-1

  14. 11月

    分子動力学計算およびNMRによるリビトール関連糖アルコールの動的構造解析

    大野 詩歩

    第11回物理·分析系若手研究者セミナー，仙台，2023年11月

  15. 12月

    リガンド結合により形成されるDectin-1オリゴマーの物理化学的解析

    真鍋 法義，大崎 暁斗，兒玉 篤治，内山 進，内橋 貴之，加藤 晃一，山口 芳樹

    第7回東北医真菌研究会東北支部会，仙台，2023年12月

2022年

論文・総説 9

  1. Characterization of novel antibodies that recognize sialylated keratan sulfate and lacto-N-fucopentaose I on human induced pluripotent cells: comparison with existing antibodies

    Hiromi Nakao, Tomoko Yamaguchi, Kenji Kawabata, Katsuaki Higashi, Motohiro Nonaka, Makoto Tuiji, Yuko Nagai, Hidenao Toyoda, Yoshiki Yamaguchi, Nobuko Kawasaki, Toshisuke Kawasaki

    Glycobiology (2022)

  2. Synthesis of the matriglycan hexasaccharide, -3Xylα1-3GlcAβ1-trimer and its interaction with laminin

    Takahiro Tamura, Yuka Omura, Kota Kotera, Ryota Ito, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Jun-Ichi Tamura

    Org. Biomol. Chem., 20, 8489-8500 (2022)

  3. Analysis of selenoprotein F binding to UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase (UGGT) by a photoreactive crosslinker

    Sayaka Higashi, Yuki Imamura, Takashi Kikuma, Takahiro Matoba, Saya Orita, Yoshiki Yamaguchi, Yukishige Ito, Yoichi Takeda

    ChemBioChem (2022)

  4. A data set of ion mobility collision cross sections and liquid chromatography retention times from 71 pyridylaminated N-linked oligosaccharides

    Noriyoshi Manabe, Shiho Ohno, Kana Matsumoto, Taiji Kawase, Kenji Hirose, Katsuyoshi Masuda, Yoshiki Yamaguchi

    J. Am. Soc. Mass Spectrom., 33, 1772-1783 (2022)

  5. Functional validation of novel variants in B4GALNT1 associated with early-onset complex hereditary spastic paraplegia with impaired ganglioside synthesis

    Julian Emanuel Alecu, Yuhsuke Ohmi, Robiul H Bhuiyan, Kei-Ichiro Inamori, Takahiro Nitta, Afshin Saffari, Hellen Jumo, Marvin Ziegler, Claudio Melo de Gusmao, Nutan Sharma, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Mariko Kambe, Keiko Furukawa, Mustafa Sahin, Jin-Ichi Inokuchi, Koichi Furakawa, Darius Ebrahimi-Fakhari

    Am. J. Med. Genet. A., 188, 2590-2598 (2022)

  6. Discovery of a lectin domain that regulates enzyme activity in mouse N-acetylglucosaminyltransferase-IVa (MGAT4A)

    Masamichi Nagae, Tetsuya Hirata, Hiroaki Tateno, Sushil K Mishra, Noriyoshi Manabe, Naoko Osada, Yuko Tokoro, Yoshiki Yamaguchi, Robert J Doerksen, Toshiyuki Shimizu, Yasuhiko Kizuka

    Commun. Biol., 5, 695 (2022)

  7. O-Glycan-dependent interaction between MUC1 glycopeptide and MY.1E12 antibody by NMR, molecular dynamics and docking simulations

    Ryoka Kokubu, Shiho Ohno, Hirohide Kuratani, Yuka Takahashi, Noriyoshi Manabe, Hiroki Shimizu, Yasunori Chiba, Kaori Denda-Nagai, Makoto Tsuiji, Tatsuro Irimura, Yoshiki Yamaguchi

    Int. J. Mol. Sci., 23, 7855 (2022)

  8. Chemical and chemo-enzymatic syntheses of glycans containing ribitol phosphate scaffolding of matriglycan

    Jun-Ichi Tamura, Takahiro Tamura, Shunsuke Hoshino, Rieko Imae, Ryuichi Kato, Mizuki Yokono, Mao Nagase, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Hiroshi Manya, Tamao Endo

    ACS Chem. Biol., 17, 1513-1523 (2022)

  9. High correlation among brain-derived major protein levels in cerebrospinal fluid: implication for amyloid-beta and tau protein changes in Alzheimer's disease

    Kyoka Hoshi, Mayumi Kanno, Mitsunari Abe, Takenobu Murakami, Yoshikazu Ugawa, Aya Goto, Takashi Honda, Takashi Saito, Takaomi C Saido, Yoshiki Yamaguchi, Masakazu Miyajima, Katsutoshi Furukawa, Hiroyuki Arai, Yasuhiro Hashimoto

    Metabolites, 12, 355 (2022)

学会発表 25

  1. 3月

    Lacto-N-fucopentaose Iの立体構造および抗iPS細胞抗体R-17Fとの相互作用の解析

    大野 詩歩，大内 陽翔，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    日本薬学会年会142年会，名古屋，2022年3月，演題番号 26L-pm09

  2. 3月

    MUC1糖ペプチドと抗MUC1抗体MY.1E12の相互作用解析

    國府 涼香，倉谷 太豪，高橋 優花，大野 詩歩，真鍋 法義，清水 弘樹，千葉靖典，伝田 香里，築地 信，入村 達郎，山口 芳樹

    日本薬学会年会142年会，名古屋，2022年3月，演題番号 26PO1-pm1-46S

  3. 3月

    NMR法によるαXyl-βGlcAの繰り返し構造とラミニンの相互作用解析

    真鍋 法義，大野 詩歩，伊藤 良汰，田村 敬裕，田村 純一，萬谷 博，遠藤 玉夫，山口 芳樹

    日本薬学会年会141年会，名古屋，2022年3月，演題番号 27C-pm05

  4. 3月

    Dectin-1と不溶性β-グルカン・Euglena gracilis EOD-1由来paramylonとの相互作用解析

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，高橋 円，大野 尚仁，山口 芳樹

    日本薬学会年会141年会，名古屋，2022年3月，演題番号28N-pm11S

  5. 5月

    Isotope labeling of glycoproteins aiming to understand the role of glycosylation by NMR

    Yoshiki Yamaguchi

    GlycoNMR Summit，online，May 2022

  6. 7月

    Analysis of conformation and interaction of αXyl-βGlcA repeating unit

    Yoshiki Yamaguchi，Noriyoshi Manabe，Shiho Ohno，Ryota Ito，Takahiro Tamura， Hiroshi Manya，Tamao Endo，Jun-ichi Tamura

    30 th International Carbohydrate Symposium，Brazil on line，July 2022

  7. 7月

    Chemical and chemo-enzymatic syntheses of glycans containing ribitol phosphate scaffolding of matriglycan

    Jun-ichi Tamura, Takahiro Tamura, Shunsuke Hoshino, Rieko Imae, Mao Nagase, Shiho Ohno, Noriyoshi Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Hiroshi Manya, and Tamao Endo

    30 th International Carbohydrate Symposium，Brazil on line，July 2022

  8. 8月

    ミスセンス変異によるタンパク質不安定化の予測

    山口 芳樹，真鍋法義，大野 詩歩

    AMED難治性疾患実用化研究事業「糖鎖異常関連疾患のワンストップ検査体制の構築と簡易診断法の開発」2022年度成果報告会，東京，2022年8月

  9. 9月

    新規アルツハイマー病マーカー: 神経細胞由来の高マンノース糖鎖含有トランスフェリン

    橋本 康弘，菅野 真由美，星 京香，山口 芳樹，齊藤 貴志，赤津 裕康，小川 倫弘，橋詰 良夫

    第41回日本糖質学会年会，大阪，2022年9月，演題番号OR1-1A

  10. 9月

    Dectin-1レクチンドメインとパラミロンを含む不溶性βグルカンとの結合 試験法の確立

    千葉 花子，真鍋 法義，内藤 淳子，西田 典永，髙橋 円，大野 尚仁，山口 芳樹

    第41回日本糖質学会年会，大阪，2022年9月，演題番号P-115

  11. 9月

    抗未分化iPS細胞抗体R-13Eとlacto-N-fucopentaose Iの相互作用解析

    大野 詩歩，大内 陽翔，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    第41回日本糖質学会年会，大阪，2022年9月，演題番号P-149

  12. 10月

    αXyl-βGlcA の繰り返し構造とラミニンの相互作用解析

    真鍋 法義，伊藤 良汰，大野 詩歩，田村 敬裕，田村 純一，萬谷 博，遠藤 玉夫，山口 芳樹

    第16回東北糖鎖研究会，福島，2022年10月，演題番号O-5

  13. 10月

    分子動力学計算によるリビトールおよび関連糖アルコールの動的構造解析

    大野 詩歩，永瀬 真央，真鍋 法義，山口 芳樹

    第16回東北糖鎖研究会，福島，2022年10月，演題番号O-6

  14. 10月

    高マンノース糖鎖を持つトランスフェリンは神経細胞に由来しアルツハイマー病の髄液マーカーとなる

    橋本 康弘 a，星 京香 b，菅野 真由美 a，山口 芳樹

    第16回東北糖鎖研究会，福島，2022年10月，演題番号O-8

  15. 10月

    NMR データを組み込んだドッキングシミュレーションによる R-13E 抗体-糖鎖リガンド複合体のモデル構築

    大内 陽翔，大野 詩歩，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    第16回東北糖鎖研究会，福島，2022年10月，演題番号P-5

  16. 10月

    非古典的な糖鎖修飾が APP の細胞内輸送と Aβの産生を決定する

    飯島 順子，立田 由里子，高橋 一人，鈴木 英明，木塚 康彦，山口芳樹，田中 克典 d，中ノ 三弥子 f，高倉 大輔 g，川崎 ナナ g，齊藤 祐子 h，萬谷 博 i，遠藤 玉夫 i，北爪 しのぶ a

    第16回東北糖鎖研究会，福島，2022年10月，演題番号P-10

  17. 11月

    NMRデータを組み入れた抗糖鎖抗体のドッキングシミュレーション

    大野 詩歩，大内 陽翔，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    第50回構造活性相関シンポジウム，オンライン，2022年11月，演題番号KO-07

  18. 11月

    糖鎖の不均一性（多様性）とその生物学的意義を求めて

    山口 芳樹

    創価大学糖鎖生命システム融合研究所コロキウム，東京，2022年11月

  19. 11月

    糖鎖の機能解明のための構造生物学‐現状と展望

    山口 芳樹

    第19回日本糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム，岐阜，2022年11月

  20. 11月

    遠隔操作による生体分子のNMR計測の実際

    山口 芳樹

    NMRプラットフォームシンポジウム2022，東京，2022年11月

  21. 11月

    βグルカンの3重らせん構造と受容体との相互作用

    山口 芳樹

    パラミロン研究会第4回学術集会，東京，2022年11月

  22. 12月

    X連鎖性劣性末節骨短縮型点状軟骨異形成症の予測と診断：コンピューター解析と新規ミスセンス変異の同定

    青木 英莉子，真鍋 法義，大野 詩歩，青木 大芽，古川 潤一，栂谷内 晶，木下聖子，井ノ口 仁一，黒澤 健司，要 匡，山口 芳樹，西原 祥子

    第45回日本分子生物学会年会，東京，2022年12月，演題番号3PW-05-2

  23. 12月

    Genes to diagnosis and therapy in glycogenomics disorders：糖鎖関連ヒト希少疾患GDP-フコース輸送体欠損症を例として

    要 匡，太田 隼人，柳 久美子，花松 久寿，Pecori Federico，古川 潤一，山口 芳樹，上原 朋子，井ノ口 仁一，木下 聖子，栂谷内 晶，佐藤 万仁，西原 祥子

    第45回日本分子生物学会年会，東京，2022年12月，演題番号3PW-05-4

  24. 12月

    マウス・ヒトDectin-1 レクチンドメインの大量発現とその性状比較

    真鍋法義，山口 芳樹

    第6回東北医真菌研究会，仙台，2022年12月

  25. 12月

    相互作用とダイナミクスから理解する糖鎖の生理機能

    山口 芳樹

    第44回東北薬学セミナー，仙台，2022年12月

2021年

論文・総説 13

  1. Identification of acetaldehyde-modified lysine

    Ban, I., Sakake, S., Kushida, N., Manabe, N., Yamaguchi, Y., Nagai, R.

    Glycative Stress Res., 8, 201-210, 2021.

  2. Ribitol in solution is an equilibrium of asymmetric conformations

    Ohno, S., Manabe, N., Yamaguchi, T., Uzawa, J., Yamaguchi, Y.

    Molecules, 26, 5471, 2021.

  3. Transferrin biosynthesized in the brain is a novel biomarker for Alzheimer's disease

    Hoshi, K., Ito, H., Abe, E., Fuwa, T.J., Kanno, M., Murakami, Y., Abe, M., Murakami, T., Yoshihara, A., Ugawa, Y., Saito, T., Saido, T.C., Matsumoto, K., Yamaguchi, Y., Furukawa, K., Arai, H., Kanai, M., Miyajima, M., Arai, H., Ogawa, N., Akatsu, H., Hashizume, Y., Tateno, H., Honda, T., Hashimoto, Y.

    Metabolites, 11, 616, 2021.

  4. Proteolytic processing, maturation, and unique synteny of the Streptomyces hemagglutinin SHA

    Fujita-Yamaguchi, Y., Muramatsu, H., Tapia, A., Bagramyan, K., Desai, M., Takehana, Y., Igarashi, M., Yamaguchi Y., Kalkum, M.

    Microbiol. Spectr., e0076621, 2021.

  5. Total transferrin in cerebrospinal fluid is a novel biomarker for spontaneous intracranial hypotension

    Iijima, J., Hoshi, K., Ito, H., Kanno, M., Murakami, Y., Takahashi, K., Matsumoto, K., Yamaguchi, Y., Nakajima, M., Miyajima, M., Arai, H., Kanai, M., Kitazume, S., Honda, T., Hashimoto, Y.

    Fukushima J. Med. Sci. 67, 64-70, 2021.

  6. Biallelic variants in LIG3 cause a novel mitochondrial neurogastrointestinal encephalomyopathy

    Bonora, E., Chakrabarty, S., Kellaris, G., Tsutsumi, M., Bianco, F., Bergamini, C., Ullah, F., Isidori, F., Liparulo, I., Diquigiovanni,C., Masin, L., Rizzardi, N., Cratere, M.G., Boschetti, E., Papa, V., Maresca, A., Cenacchi, G., Casadio, R., Martelli, P., Matera, I., Ceccherini, I., Fato, R., Raiola, G., Arrigo, S., Signa, S., Sementa, A.R., Severino, M., Striano, P., Fiorillo, C., Goto, T., Uchino, S., Oyazato, Y., Nakamura, H., Mishra, S.K., Yeh, Y.S., Kato, T., Nozu, K., Tanboon, J., Morioka, I., Nishino, I., Toda, T., Goto, Y., Ohtake, A., Kosaki, K., Yamaguchi Y, Nonaka, I., Iijima, K., Mimaki, M., Kurahashi, H., Raams, A., MacInnes, A., Alders, M., Engelen, M., Linthorst, G., Koning, T.D., Dunnen W.D., Dijkstra, G., Spaendonck, K.V., Gent, D.C.V., Aronica, E.M., Picco, P., Carelli, V., Seri, M., Katsanis, N., Duijkers, F.A.M., Taniguchi-Ikeda M., Giorgio, R.D.

    Brain, 144, 1451-1466, 2021.

  7. 3D structural view of pathogen recognition by mammalian lectin receptors.

    Manabe, N., Yamaguchi, Y.

    Front. Mol. Biosci., 8, 670780, 2021.DOI

  8. Antibody glycoengineering and homogeneous antibody-drug conjugate preparation.

    Manabe, S., Yamaguchi, Y.

    Chem. Rec. 2021 Apr 22.DOI

  9. NMR assignments of the N-glycans of the Fc fragment of mouse immunoglobulin G2b glycoprotein.

    Yanaka, S., Yamaguchi, Y., Takizawa, T., Miyanoiri, Y., Yogo, R., Shimada, I., and Kato, K.

    Biomol. NMR Assign., 15, 187-192, 2021.

  10. 3D structural insights into b-glucans and their binding proteins.

    Manabe, N., and Yamaguchi, Y.

    Int. J. Mol. Sci., 22(4), 1578, 2021.DOI

  11. Pick’s Tau fibril shows multiple distinct PET probe binding sites: Insights from computational modelling.

    Mishra, S.K., Yamaguchi, Y., Higuchi, M, Sahara, N.

    Int. J. Mol. Sci., 22(1), 349, 2021.DOI

  12. High-contrast in vivo imaging of tau pathologies in Alzheimer's and non-Alzheimer's disease tauopathies.

    Tagai, K., Ono, M., Kubota, M., Kitamura, S., Takahata, K., Seki, C., Takado, Y., Shinotoh, H., Sano, Y., Yamamoto, Y., Matsuoka, K., Takuwa, H., Shimojo, M., Takahashi, M., Kawamura, K., Kikuchi, T., Okada, M., Akiyama, H., Suzuki, H., Onaya, M., Takeda, T., Arai, K., Arai, N., Araki, N., Saito, Y., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. Y., Mishra, S. K., Yamaguchi, Y., Kimura, Y., Ichise, M., Tomita, Y., Zhang, M. R., Suhara, T., Shigeta, M., Sahara, N., Higuchi, M., and Shimada, H.

    Neuron 109, 42-58 e48, 2021.

  13. 分岐型糖鎖の高次構造と相互作用原理の解明

    山口 芳樹

    BIO Clinica, 36, 79-84, 2021.

学会発表 14

  1. 3月

    ヒトシアル酸転移酵素ST3Gal5の立体構造モデリングと基質結合部位の予測

    兼瀬 鑑，大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    日本薬学会年会141年会，広島，2021年3月，演題番号27P01-101S

  2. 3月

    NMR法によるペプチド中のAsp残基異性化のin situ判別

    真鍋 法義，大野 詩歩，山口 芳樹

    日本薬学会年会141年会，広島，2021年3月，演題番号28P01-085

  3. 3月

    非環状糖鎖成分リビトールの動的構造解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 拓実，鵜澤 洵，山口 芳樹

    日本薬学会年会141年会，広島，2021年3月，演題番号29P01-079

  4. 9月

    液体クロマトグラフィー/イオンモビリティー質量分析法を利用した57種類のN-結合型糖鎖の保持時間・衝突断面積・m/zのデータセット

    真鍋法義，大野詩歩，川瀬泰司，廣瀬賢治，山口芳樹

    第33回バイオメディカル分析科学シンポジウム（BMAS2021），京都，2021年9月，演題番号P23

  5. 9月

    MUC1糖ペプチドと抗MUC1抗体MY.1E12のNMR相互作用解析とドッキングシミュレーション

    國府 涼香，倉谷 太豪，高橋 優花，大野 詩歩，真鍋 法義，清水 弘樹，千葉 靖典，伝田 香里，築地 信，入村 達郎，山口 芳樹

    第15回東北糖鎖研究会，岩手，2021年9月，演題番号O-5

  6. 9月

    非環状糖鎖成分リビトールリン酸の構造解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，田村 純一，山口 芳樹

    第15回東北糖鎖研究会，岩手，2021年9月，演題番号P-7

  7. 9月

    Structural role of N-glycosylation on human IgA and J chain

    Pan Shunli，Noriyoshi Manabe，Yoshiki Yamaguchi

    第15回東北糖鎖研究会，岩手，2021年9月，演題番号P-8

  8. 10月

    新規ミスセンス変異を認めた本邦初のB4GALNT1関連神経変性症の1例

    中村 勝哉，土田 奈緒美，井ノ口 仁一，小島 朋美，池田 淳司，小平 農，稲森 啓一郎，永福 正和，新田 昂大，真鍋 法義，大野 詩歩，山口 芳樹，下畑 享良，松本 直通，古庄 知己，関島 良樹

    日本人類遺伝学会第66回大会第28回日本遺伝子診療学会大会合同開催，横浜，2021年10月，演題番号P15-16

  9. 10月

    タンデムリビトールリン酸含有O-マンノシルグリカンの系統的合成とその糖鎖

    田村 純一，田村 敬裕，真鍋 法義，大野 詩歩，山口 芳樹，萬谷 博，遠藤 玉夫

    第40回日本糖質学会年会，鹿児島，2021年10月，演題番号1B-01(A)

  10. 10月

    NMR法による GlcA/Xylリピートとラミニンの相互作用様式の解析

    真鍋 法義，大野 詩歩，田村 敬裕，田村 純一，萬谷 博，遠藤 玉夫，山口 芳樹

    第40回日本糖質学会年会，鹿児島，2021年10月，演題番号1C-03(B)

  11. 10月

    抗iPS細胞抗体R-17Fとlacto-N-fucopentaose Iの相互作用解析

    大野 詩歩，齋藤 祐希，真鍋 法義，湯浅 徳行，松崎 祐二，築地 信，川嵜 敏祐，山口 芳樹

    第40回日本糖質学会年会，鹿児島，2021年10月，演題番号P-127

  12. 10月

    全ヒト糖鎖関連遺伝子 Variantの網羅的抽出と解析

    西原 祥子，木下 聖子，栂谷 内晶，細田 正恵，伊藤 和義，山口 芳樹，真鍋 法義，大野 詩歩，稲森 啓一郎，井ノ口 仁一，灘中 里美，北川 裕之，城田 松之，木下 賢吾

    第40回日本糖質学会年会，鹿児島，2021年10月，演題番号3C-02(A)

  13. 10月

    3D structural view of β-glucan and its receptors

    Yoshiki Yamaguchi and Noriyoshi Manabe

    第65回日本医真菌学会総会・学術総会/真菌症フォーラム2021, Tokyo, Japan, Oct. 2021, 16:10-17:50

  14. 12月

    水溶性・不溶性β-glucanとDectin-1受容体との相互作用解析

    真鍋 法義

    第5回東北医真菌研究会, 仙台, 2021年12月

2020年

論文・総説 13

  1. Chemical synthesis of residue-selectively 13C and 2H double-isotope-labeled oligosaccharides as chemical probes for the NMR-based conformational analysis of oligosaccharides.

    Hamagami, H., Yamaguchi, Y., and Tanaka, H.

    J. Org. Chem., 85, 16115-16127, 2020.

  2. Pick's tau fibril shows multiple distinct PET probe binding sites: Insights from computational modelling.

    Mishra, S. K., Yamaguchi, Y., Higuchi, M., and Sahara, N.

    Int. J. Mol. Sci., 22, 349, 2020.

  3. Short disordered protein segment regulates cross-species transmission of a yeast prion.

    Shida T, Kamatari YO, Yoda T, Yamaguchi Y, Feig M, Ohhashi Y, Sugita Y, Kuwata K, Tanaka M

    Nat. Chem. Biol., 16, 756-765, 2020.DOI

  4. Solid-state 17O NMR analysis of synthetically 17O-enriched D-glucosamine.

    Yamada K, Yamaguchi Y, Uekusa Y, Aoki K, Shimada I, Yamaguchi T, Kato K

    Chem. Phys. Lett., 749, 137455, 2020.

  5. Discovery of a new sialic acid binding region that regulates Siglec-7

    Yamakawa N, Yasuda Y, Yoshimura A, Goshima A, Crocker R P, Vergoten G, Nishiura Y, Takahashi T, Hanashima S, Matsumoto K, Yamaguchi Y, Tanaka H, Kitajima K, Sato C

    Sci Rep., 10, 8647, 2020.

  6. Molecular dynamics simulation of glycans

    Re S, Yamaguchi Y, Sugita Y

    Trends Glycosci. Glycotechnol. 32, E113-E118, 2020.

  7. Glucocerebrosidases catalyze a transgalactosylation reaction that yields a newly-identified brain sterol metabolite, galactosylated cholesterol.

    Akiyama H, Ide M, Nagatsuka Y, Sayano T, Nakanishi E, Uemura N, Yuyama K, Yamaguchi Y, Kamiguchi H, Takahashi R, Aerts JMFG, Greimel P, Hirabayashi Y

    J. Biol. Chem., 295(16), 5257-5277, 2020.DOI

  8. Annexin A4 inhibits sulfatide-induced activation of coagulation factor XII.

    Nakayama M, Miyagawa H, Kuranami Y, Tsunooka-Ota M, Yamaguchi Y, Kojima-Aikawa K

    J. Thromb Haemost., 18, 1357-1369, 2020DOI

  9. 3D Structure and function of glycosyltransferases involved in N-glycan maturation

    Masamichi Nagae, Yoshiki Yamaguchi, Naoyuki Taniguchi and Yasuhiko Kizuka

    Int. J. Mol. Sci., 21(2) 437, 2020

  10. Structural aspects of carbohydrate recognition mechanisms of C-type lectins

    Nagae Masamichi, Yoshiki Yamaguchi

    Current Topics in Microbiology and Immunology, 429, 147-176, 2020

  11. A synopsis of recent developments defining how N-glycosylation impacts immunoglobulin G structure and function

    Yoshiki Yamaguchi, Adam W Barb

    Glycobiology, 30, 214-225, 2020

  12. 有機合成化学/糖質化学は抗体-薬物複合体開発にどのように貢献できるか：糖鎖連結均一抗体-薬物複合体合成とがん間質ターゲティング療法の開拓

    眞鍋史乃, 山口芳樹, 松村保広

    有機合成化学協会誌, 78, 485-494, 2020.

  13. 糖鎖立体構造解析技術の開発要素

    山口芳樹

    生化学, 92, 369-377, 2020.

学会発表 17

  1. 1月

    糖鎖構造の多様性の生物学的意義を求めて

    山口 芳樹

    第16回機能性糖鎖研究会，鳥取，2020年1月，16:30-18:00薬品物理化学教室

  2. 1月

    NMR analysis of glycolipid in aqueous solution

    Yoshiki Yamaguchi

    International Symposium on Glyco-lipidologue, Wako, Japan, Jan. 2020, 16:05-16:35薬品物理化学教室

  3. 3月

    計算化学によるリビトールのコンフォメーション空間の解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    日本薬学会第140年会，京都，2020年3月，演題番号27P-am103薬品物理化学教室

  4. 3月

    紫外線照射によるトリプトファン残基の化学構造変化

    真鍋 法義，星 憲司，大野 詩歩，山口 芳樹

    日本薬学会第140年会，京都，2020年3月，演題番号27P-am079薬品物理化学教室

  5. 3月

    完全重水素化シクロデキストリンの酵素化学合成と糖脂質のNMR解析への応用

    山口 芳樹，眞鍋 史乃，Peter Greimel，伊藤 幸成

    日本薬学会第140年会，京都，2020年3月，演題番号27H-pm13薬品物理化学教室

  6. 8月

    免疫グロブリンG結合糖鎖の立体構造データの調査

    佐藤 いずみ，大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    第14回東北糖鎖研究会，仙台オンライン開催，2020年8月，演題番号O-5薬品物理化学教室

  7. 8月

    糖鎖認識抗体の設計を目指した特異的CDR配列の検討

    瀬川 千夏，真鍋 法義，大野 詩歩，山口 芳樹

    第14回東北糖鎖研究会，仙台オンライン開催，2020年8月，演題番号P-1薬品物理化学教室

  8. 8月

    非環状糖リビトールの計算化学とNMRによる動的構造解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    第14回東北糖鎖研究会，仙台オンライン開催，2020年8月，演題番号P-2薬品物理化学教室

  9. 9月

    糖鎖認識抗体によるエピトープ認識の分子基盤

    川嵜 敏祐，中尾 広美，川嵜 伸子，築地 信，稲垣 優希，吉田 昌宏，山口 芳樹，天野 裕之，大野 詩歩，真鍋 法義

    第93回日本生化学会大会，京都，2020年9月，演題番号P-046(2Z01-11)薬品物理化学教室

  10. 9月

    コアフコース含有N-グリカンの機能解明・制御を目指したケミカルバイオロジー

    真鍋 良幸，MARCHETTI Roberta，武部 智之，笠原 里実，高倉 陽平，長崎 政裕，二瓶 渉，田中 克典，樺山 一哉，CHIODO Fabrizio，花島 慎弥，鎌田 佳宏，三善 英知，DULAL Hari Prasad，山口 芳樹，安達 禎之，大野 尚仁，田中 浩士，SILIPO Alba，MOLINARO Antonio，深瀬 浩一

    第62回天然有機化合物討論会，名古屋オンライン開催，2020年9月，演題番号24薬品物理化学教室

  11. 10月

    非環状の糖鎖成分リビトールの静的および動的構造の解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 拓実，鵜澤 洵，山口 芳樹

    第59回日本薬学会東北支部大会，紙上発表，2020年10月，演題番号PB-16薬品物理化学教室

  12. 11月

    コアフコース含有N-グリカン認識レクチンの探索

    真鍋 良幸，MARCHETTI Roberta，高倉 陽平，長崎 政裕，二瓶 渉，武部 智之，田中 克典，樺山 一哉，CHIODO Fabrizio，花島 慎弥，鎌田 佳宏，三善 英知，DULAL Hari Prasad，山口 芳樹，安達 禎之，大野 尚仁，田中 浩士，SILIPO Alba，MOLINARO Antonio，深瀬 浩一

    第39回日本糖質学会年会，紙上開催，2020年11月薬品物理化学教室

  13. 11月

    抗糖鎖抗体の立体構造データベース構築と抗原結合部位の解析

    瀬川 千夏，真鍋 法義，大野 詩歩，山口 芳樹

    第39回日本糖質学会年会，紙上開催，2020年11月薬品物理化学教室

  14. 11月

    NMR法と分子動力学計算による非環状糖リビトールの動的構造解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 拓実，鵜澤 洵，山口 芳樹

    第39回日本糖質学会年会，紙上開催，2020年11月薬品物理化学教室

  15. 11月

    プリオン感染における「種の壁」を解明

    志田俊信，鎌足雄司，依田隆夫，山口芳樹，Michael Feig，大橋祐美子，杉田有治，桑田一夫，田中元雅

    第59回NMR討論会，群馬，2020年11月，演題番号P29薬品物理化学教室

  16. 12月

    NMR approach to investigate glycan structure and function

    Yoshiki Yamaguchi

    14th Chandigarh Science Congress-2020 (CHASCON-2020), India on line, Dec. 2020薬品物理化学教室

  17. 12月

    βグルカンの立体構造とその相互作用

    山口芳樹

    第4回東北医真菌研究会，オンライン開催，2020年12月，11:15-11:55薬品物理化学教室

2019年

論文・総説 12

  1. Synthesis of the core oligosaccharides of lipooligosaccharides from Campylobacter jejuni: A putative cause of Guillain-Barre syndrome

    Fumi Yoshida, Hiroki Yoshinaka, Hidenori Tanaka, Shinya Hanashima, Yoshiki Yamaguchi, Mikio Ishihara, Miyuki Saburomaru, Yuki Kato, Risa Saito, Hiromune Ando, Makoto Kiso, Akihiro Imamura, Hideharu Ishida

    Chem. Eur. J., 25, 796-805 (2019)

  2. Structural analysis of a novel lipooligosaccharide (LOS) from Rhodobacter azotoformans

    Yoshimi Kanie, Yoshiki Yamaguchi, Akiyoshi Hayashi, Jun Uzawa, Makoto Hatakeyama, Yasuhiro Hidaka, Nobuhiro Toda, Shinichiro Nakamura, Osamu Kanie

    Carbohydr Res., 473, 104-114 (2019)

  3. Complementary design for pairing between two types of nanoparticles mediated by a bispecific antibody: Bottom-up formation of porous materials from nanoparticles

    Teppei Niide, Noriyoshi Manabe, Hikaru Nakazawa, Kazuto Akagi, Takamitsu Hattori, Izumi Kumagai, Mitsuo Umetsu

    Langmuir, 35, 3067-3076 (2019)

  4. Characterization of antibody products obtained through enzymatic and nonenzymatic glycosylation reactions with a glycan oxazoline and preparation of a homogeneous antibody-drug conjugate via Fc N-Glycan

    Shino Manabe, Yoshiki Yamaguchi, Kana Matsumoto, Hirobumi Fuchigami, Taiji Kawase, Kenji Hirose, Ai Mitani, Wataru Sumiyoshi, Takashi Kinoshita, Junpei Abe, Masahiro Yasunaga, Yasuhiro Matsumura, and Yukishige Ito

    Bioconjugate Chem., 30, 1343-1355 (2019)

  5. Synthesis and glycan-protein interaction studies of Se-sialosides by 77Se NMR

    Tatsuya Suzuki, Chieka Hayashi, Naoko Komura, Rie Tamai, Jun Uzawa, Junya Ogawa, Hide-Nori Tanaka, Akihiro Imamura, Hideharu Ishida, Makoto Kiso, Yoshiki Yamaguchi, Hiromune Ando

    Org. Lett., 21, 6393-6396 (2019)

  6. Bisecting GlcNAc is a general suppressor of terminal modification of N-glycan

    Miyako Nakano, Sushil K. Mishra, Yuko Tokoro, Keiko Sato, Kazuki Nakajima, Yoshiki Yamaguchi, Naoyuki Taniguchi, Yasuhiko Kizuka

    Mol. & Cell. Proteomics, 18, 2044-2057 (2019)

  7. A struggle of the last eleven years after getting JSCR award

    Yoshiki Yamaguchi

    Trends Glycosci. Glycotechnol. 31, SE50-SE52, SJ50-SJ52 (2019)

  8. Conformational analysis of glycans

    Yoshiki Yamaguchi

    Glycoscience: Basic Science to Applications, pp. 40-41 (2019)

  9. Computational science (supercomputer) and AI (artificial intelligence)

    Yoshiki Yamaguchi

    Glycoscience: Basic Science to Applications, pp. 42-43 (2019)

  10. Core technologies for elucidating the role of glycans in disease

    Yoshiki Yamaguchi

    Glycoscience: Basic Science to Applications, pp. 265-266 (2019)

  11. レクチンの糖鎖認識とは

    山口芳樹

    医学のあゆみ, 269, 750-755 (2019)

  12. 糖鎖改変による抗体―薬物複合体合成

    眞鍋 史乃, 山口芳樹

    月刊ファインケミカル, 48, 51-59 (2019)

学会発表 19

  1. 2月

    Asp-Aspモチーフにおける非酵素反応

    大野 詩歩

    第7回物理・分析系若手研究者セミナー，仙台，2019年2月薬品物理化学教室

  2. 3月

    リン酸二水素イオンを触媒とするAsp-Ser配列からのスクシンイミド生成

    大野 詩歩，真鍋 法義，高橋 央宜

    日本薬学会第139年会，千葉，2019年3月，演題番号p.143薬品物理化学教室

  3. 3月

    白内障の病態形成に関与するクリスタリン中Asp残基異性化の乳酸による触媒機構～計算化学的・生化学的検討～

    真鍋 法義，佐々木 雅人，田中 大，大野 賢一，大野 詩歩，桐越 亮太，加藤創，藤村 務，柴田 信之，高橋 央宜

    日本薬学会第139年会，千葉，2019年3月，要旨集p.161薬品物理化学教室

  4. 5月

    Solution NMR and docking simulation analysis of interaction between tau aggregates and low-molecular-weight compounds

    Yoshiki Yamaguchi

    International Academic Forum on Neuroinflammation and Psychopharmacology, Nantong, China, May 2019, 演題番号 3薬品物理化学教室

  5. 5月

    錠剤観察における走査電子顕微鏡用の広領域断面作製法

    應本 玉恵，淺野 奈津子，朝比奈 俊輔，真鍋 法義

    日本薬剤学会第34年会，富山，2019年5月，要旨集p.42薬品物理化学教室

  6. 5月

    錠剤成分の分布分析に用いる断面試料の作製とその分析法

    真鍋 法義，應本 玉恵，淺野 奈津子，長谷部 祐治，朝比奈 俊輔

    日本薬剤学会第34年会，富山，2019年5月，要旨集p.65薬品物理化学教室

  7. 7月

    糖鎖の構造解析とその機能の解明

    山口 芳樹

    日本臓器製薬（株）特別講演会，兵庫，2019年7月，演題番号 2薬品物理化学教室

  8. 8月

    水溶液中における糖脂質の脱ミセル化とNMR法による性状解析

    山口 芳樹

    第38回日本糖質学会年会，名古屋，2019年8月，演題番号 WS-04薬品物理化学教室

  9. 9月

    糖鎖構造の多様性とその生物学的意義の探求

    山口 芳樹

    第13回東北糖鎖研究会，新潟，2019年9月，演題番号 S-1薬品物理化学教室

  10. 9月

    グルコシルセラミド分解酵素による新規脳内ステロール代謝物・ステロール配糖体の代謝制御

    秋山 央子，井手 三津子，中西 悦郎，上村 紀仁，山口 芳樹，Peter Greimel，上口 裕之，高橋 良輔，平林 義雄

    第92回日本生化学大会，新潟，2019年9月，演題番号1P-011 (1T10a-06)薬品物理化学教室

  11. 10月

    Solution NMR and docking simulation analysis of interaction between tau aggregates and small chemicals

    Yoshiki Yamaguchi

    Asian Pacific Prion Symposium2019 (APPS2019), Wako, October 2019, 演題番号 O-3薬品物理化学教室

  12. 10月

    糖鎖プローブを活用した構造解析

    山口 芳樹

    Pioneering Project: Chemical Probe（生命現象探索分子）第二回合同合宿セミナー，比企，2019年10月，演題番号OP-3薬品物理化学教室

  13. 10月

    計算化学によるリビトールのコンフォメーション空間の解析

    大野 詩歩，真鍋 法義，山口 芳樹

    第58回日本薬学会東北支部大会，仙台，2019年10月，演題番号PE-08薬品物理化学教室

  14. 10月

    糖鎖の高次構造と相互作用原理の解明に向けて

    山口 芳樹

    第17回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム，京都，2019年10月，要旨集p.14薬品物理化学教室

  15. 11月

    完全重水素化シクロデキストリンの化学酵素合成と糖脂質のNMR解析

    山口 芳樹，眞鍋 史乃，Peter Greimel，伊藤 幸成

    第58回NMR討論会・SEST2019合同シンポジウム，川崎，2019年11月，演題番号 P41薬品物理化学教室

  16. 11月

    残余双極子カップリング測定における配向力、温度安定性、有機溶媒耐性を兼ね備えた新規配向剤

    内田 紀之，山口 芳樹，海老名 保男，佐々木 高義，石田 康博

    第58回NMR討論会・SEST2019合同シンポジウム，川崎，2019年11月，演題番号 L3-3薬品物理化学教室

  17. 11月

    NMR structural analysis of glycolipid in aqueous solution

    Yoshiki Yamaguchi, Shino Manabe, Peter Greimel, Yukishige Ito

    11th ACGG Conference, Busan, Korea, November 2019, 演題番号SS 8-3薬品物理化学教室

  18. 11月

    糖鎖構造解析の基礎とその実際

    山口 芳樹

    第410回CBI学会講演会，田町，2019年11月，演題番号 2薬品物理化学教室

  19. 12月

    An NMR approach to investigate glycolipid structure

    Yoshiki Yamaguchi

    TMPU-AS Joint Glycoscience Symposium, Taipei, Taiwan, December 2019薬品物理化学教室